1603年，蒙古布延薛禅汗去世，次年由他的长孙林丹汗继位。林丹汗即位后，在巴林部境内的阿巴噶哈喇山修建了瓦察尔图察汉浩特作为整个蒙古的**、军事、经济、文化中心。林丹汗加强了传统的左右翼三万户的地方行政体制，命永谢布部却热斯塔布囊为特命大臣，率领一支**驻防赵城(今呼和浩特一带)，管理右翼三万户的蒙古各部，任命乌齐叶特(内喀尔喀)鄂托克锡尔呼纳克洪台吉为管理左翼三万户的特命大臣。察哈尔八鄂托克虽属左翼三万户，但直属林丹汗。林丹汗为了有效地控制蒙古各部和巩固汗权，以察哈尔部为基础，直接控制了内喀尔喀巴林、札鲁特、巴岳特、乌齐叶特、弘吉剌特等五部，同时也遥控了蒙古其他各部。林丹汗执政前期，漠北喀尔喀三汗以及漠南喀喇沁的昆都伦汗、阿鲁科尔沁的车根汗、科尔沁奥巴洪台吉、鄂尔多斯土巴济农等，定期前往察汉浩特，朝见林丹汗，并与大汗共同商讨政务大事，参加大汗举行的宴会、围猎等活动。蒙古各部汗、济农、诺延、台吉，按照图们札萨克图汗**约束诸鄂托克，并定期向林丹汗朝贡献物(《大黄册》，1957年列宁格勒版)。1603年，蒙古布延薛禅汗去世，次年由他的长孙林丹汗继位。林丹汗即位后，在巴林部境内的阿巴噶哈喇山修建了瓦察尔图察汉浩特作为整个蒙古的**、军事、经济、文化中心。林丹汗加强了传统的左右翼三万户的地方行政体制，命永谢布部却热斯塔布囊为特命大臣，率领一支**驻防赵城(今呼和浩特一带)，管理右翼三万户的蒙古各部，任命乌齐叶特(内喀尔喀)鄂托克锡尔呼纳克洪台吉为管理左翼三万户的特命大臣。察哈尔八鄂托克虽属左翼三万户，但直属林丹汗。林丹汗为了有效地控制蒙古各部和巩固汗权，以察哈尔部为基础，直接控制了内喀尔喀巴林、札鲁特、巴岳特、乌齐叶特、弘吉剌特等五部，同时也遥控了蒙古其他各部。林丹汗执政前期，漠北喀尔喀三汗以及漠南喀喇沁的昆都伦汗、阿鲁科尔沁的车根汗、科尔沁奥巴洪台吉、鄂尔多斯土巴济农等，定期前往察汉浩特，朝见林丹汗，并与大汗共同商讨政务大事，参加大汗举行的宴会、围猎等活动。蒙古各部汗、济农、诺延、台吉，按照图们札萨克图汗**约束诸鄂托克，并定期向林丹汗朝贡献物(《大黄册》，1957年列宁格勒版)。1621年三月，努尔哈赤和诸贝勒率领大军，**沈阳，打败明军7万守城部队，占领了沈阳城。努尔哈赤留下部分兵力驻守沈阳，指挥其余大部分兵力，准备乘胜攻取辽阳城。林丹汗得知后金占领沈阳并留下少数部队守护的情报后，令管理蒙古左翼三万户的大臣，乌齐叶特鄂托克的锡尔呼纳克杜棱洪台吉率领内喀尔喀卓哩克图诺延、达尔汉巴图尔、巴哈达尔汉等2000骑兵前往沈阳营救被禁的齐赛诺延。锡尔呼纳克杜棱洪台吉所率轻骑到达沈阳城下，与守城部队展开激战。但蒙古**担心努尔哈赤的援兵前来增援，便撤回蒙古本土。1621年八月，内喀尔喀五部送万头牲畜，赎回了弘吉剌特鄂托克齐赛诺延。1603年1612年，后金国主努尔哈赤遣人至蒙古科尔沁部，娶明安台吉女为妃。1614年四月，努尔哈赤第二子代善娶科尔沁札鲁特台吉钟**为妻。同月，札鲁特内齐汗，将其妹嫁与努尔哈赤五子莽古尔泰。接着，努尔哈赤第四子皇太极娶科尔沁部莽古思台吉女为妃。同年十二月，札鲁特部额尔济格台吉女嫁给努尔哈赤第十子德格雷。1615年努尔哈赤又纳科尔沁孔果尔台吉女为妃。1617年内喀尔喀巴岳特鄂托克达尔汉巴图尔诺延之子恩格德尔娶女真舒尔哈齐四女为妻。经如此频繁的联姻，减少了来自蒙古方面的压力，使努尔哈赤集中精力去对付明朝。1618年四月起，努尔哈赤指挥后金大军，先后攻克了明朝的辽东要镇抚顺、开原、铁岭，并取得了萨尔浒大捷，歼灭了明朝在辽东地区的有生力量。1621年三月，努尔哈赤攻取沈阳后，乘胜攻克了辽阳城，四月迁都辽阳。1622年正月，努尔哈赤率领大军西渡辽河，攻下了明朝的军事重镇广宁(也称北镇)。1625年迁国都于沈阳。此时，后金国主努尔哈赤完全扫除了明朝在辽东地区的势力。巩固了在辽东的统治后，他将注意力逐渐转向了蒙古察哈尔部。首先对察哈尔的外围内喀尔喀、科尔沁等部采取了离间、拉拢、威胁等手段，以孤立和削弱林丹汗的势力。1619年七月的铁岭战役后，努尔哈赤频繁遣人至内喀尔喀，要求诸台吉与后金盟誓修好，共同对付明朝。努尔哈赤与内喀尔喀建立同盟的目的是为了离间内喀尔喀与林丹汗的关系。十一月，在内兴安岭的色特尔黑地方，内喀尔喀五部部分台吉与努尔哈赤所遣使臣额克星额、绰库尔、雅希禅、库尔禅等刑白马乌牛，设酒盟誓，表示彼此修好，与明朝为敌(《皇清开国方略》卷6)。1621年十一月，内喀尔喀五部的古尔布什、奔古勒二台吉率领所属六百户，至辽阳归附于后金(《皇清开国方略》卷7)。努尔哈赤设大宴迎接，并将松古图公主嫁给了古尔布什台吉。内喀尔喀部分台吉与后金通婚、盟誓等事，引起了林丹汗的疑心。他严厉指责管理左翼三万户的大臣锡尔呼纳克杜棱洪台吉管束不得力，甚至怀疑他暗中与努尔哈赤已有联系，准备对锡尔呼纳克杜棱洪台吉和其他诸台吉采取必要的措施。这反而加速了蒙古内部的分化。本来从林丹汗信奉红教后，尊崇宗喀巴黄教多年的漠北喀尔喀以及漠南影响较大的诸部，已与林丹汗貌合神离，开始自行其是了。1622年二月，管理左翼三万户的特命大臣锡尔呼纳克杜棱洪台吉与林丹汗发生分歧，遂率领所属乌齐叶特部与明安谔勒哲依图台吉所属乌噜特部共三千多户，投奔辽阳城，归顺了努尔哈赤。受其影响，1623年正月，内喀尔喀拉巴什希布、索诺木、莽果、**台吉等也各率所属五百户投奔了辽阳城。此时，乌珠穆沁部翁衮都喇尔子多尔济**济农与其叔之子塞棱**台吉也因与林丹汗不和，率部投奔了漠北喀尔喀**汗硕垒。苏尼特部素塞巴图噜济农、浩齐特部策凌伊尔登、阿巴噶部都思噶尔札萨克图济农各率所部，也投奔了漠北喀尔喀**汗硕垒。针对锡尔呼纳克杜棱等台吉投奔努尔哈赤，林丹汗传令内喀尔喀和科尔沁部，不得与后金使臣擅自往来，若被发现，定要兴师问罪。1621年三月，努尔哈赤和诸贝勒率领大军，**沈阳，打败明军7万守城部队，占领了沈阳城。努尔哈赤留下部分兵力驻守沈阳，指挥其余大部分兵力，准备乘胜攻取辽阳城。林丹汗得知后金占领沈阳并留下少数部队守护的情报后，令管理蒙古左翼三万户的大臣，乌齐叶特鄂托克的锡尔呼纳克杜棱洪台吉率领内喀尔喀卓哩克图诺延、达尔汉巴图尔、巴哈达尔汉等2000骑兵前往沈阳营救被禁的齐赛诺延。锡尔呼纳克杜棱洪台吉所率轻骑到达沈阳城下，与守城部队展开激战。但蒙古**担心努尔哈赤的援兵前来增援，便撤回蒙古本土。1621年八月，内喀尔喀五部送万头牲畜，赎回了弘吉剌特鄂托克齐赛诺延。1603年1612年，后金国主努尔哈赤遣人至蒙古科尔沁部，娶明安台吉女为妃。1614年四月，努尔哈赤第二子代善娶科尔沁札鲁特台吉钟**为妻。同月，札鲁特内齐汗，将其妹嫁与努尔哈赤五子莽古尔泰。接着，努尔哈赤第四子皇太极娶科尔沁部莽古思台吉女为妃。同年十二月，札鲁特部额尔济格台吉女嫁给努尔哈赤第十子德格雷。1615年努尔哈赤又纳科尔沁孔果尔台吉女为妃。1617年内喀尔喀巴岳特鄂托克达尔汉巴图尔诺延之子恩格德尔娶女真舒尔哈齐四女为妻。经如此频繁的联姻，减少了来自蒙古方面的压力，使努尔哈赤集中精力去对付明朝。1618年四月起，努尔哈赤指挥后金大军，先后攻克了明朝的辽东要镇抚顺、开原、铁岭，并取得了萨尔浒大捷，歼灭了明朝在辽东地区的有生力量。1621年三月，努尔哈赤攻取沈阳后，乘胜攻克了辽阳城，四月迁都辽阳。1622年正月，努尔哈赤率领大军西渡辽河，攻下了明朝的军事重镇广宁(也称北镇)。1625年迁国都于沈阳。此时，后金国主努尔哈赤完全扫除了明朝在辽东地区的势力。巩固了在辽东的统治后，他将注意力逐渐转向了蒙古察哈尔部。首先对察哈尔的外围内喀尔喀、科尔沁等部采取了离间、拉拢、威胁等手段，以孤立和削弱林丹汗的势力。1619年七月的铁岭战役后，努尔哈赤频繁遣人至内喀尔喀，要求诸台吉与后金盟誓修好，共同对付明朝。努尔哈赤与内喀尔喀建立同盟的目的是为了离间内喀尔喀与林丹汗的关系。十一月，在内兴安岭的色特尔黑地方，内喀尔喀五部部分台吉与努尔哈赤所遣使臣额克星额、绰库尔、雅希禅、库尔禅等刑白马乌牛，设酒盟誓，表示彼此修好，与明朝为敌(《皇清开国方略》卷6)。1621年十一月，内喀尔喀五部的古尔布什、奔古勒二台吉率领所属六百户，至辽阳归附于后金(《皇清开国方略》卷7)。努尔哈赤设大宴迎接，并将松古图公主嫁给了古尔布什台吉。内喀尔喀部分台吉与后金通婚、盟誓等事，引起了林丹汗的疑心。他严厉指责管理左翼三万户的大臣锡尔呼纳克杜棱洪台吉管束不得力，甚至怀疑他暗中与努尔哈赤已有联系，准备对锡尔呼纳克杜棱洪台吉和其他诸台吉采取必要的措施。这反而加速了蒙古内部的分化。本来从林丹汗信奉红教后，尊崇宗喀巴黄教多年的漠北喀尔喀以及漠南影响较大的诸部，已与林丹汗貌合神离，开始自行其是了。1622年二月，管理左翼三万户的特命大臣锡尔呼纳克杜棱洪台吉与林丹汗发生分歧，遂率领所属乌齐叶特部与明安谔勒哲依图台吉所属乌噜特部共三千多户，投奔辽阳城，归顺了努尔哈赤。受其影响，1623年正月，内喀尔喀拉巴什希布、索诺木、莽果、**台吉等也各率所属五百户投奔了辽阳城。此时，乌珠穆沁部翁衮都喇尔子多尔济**济农与其叔之子塞棱**台吉也因与林丹汗不和，率部投奔了漠北喀尔喀**汗硕垒。苏尼特部素塞巴图噜济农、浩齐特部策凌伊尔登、阿巴噶部都思噶尔札萨克图济农各率所部，也投奔了漠北喀尔喀**汗硕垒。针对锡尔呼纳克杜棱等台吉投奔努尔哈赤，林丹汗传令内喀尔喀和科尔沁部，不得与后金使臣擅自往来，若被发现，定要兴师问罪。1632年三月，皇太极决定第三次远征察哈尔林丹汗，传令归顺后金的蒙古各部速率部来会。四月，科尔沁、札鲁特、巴林、奈曼、敖汉、喀喇沁、土默特、阿鲁科尔沁、翁牛特、阿苏特等部的部长台吉会于西拉木伦河岸，总兵力约10万。四月下旬，皇太极率领大军越过兴安岭，驻守都埒河。当夜，镶黄旗两个蒙古人偷马逃出，将大军压境的消息报告给林丹汗。林丹汗欲率部撤至漠北喀尔喀，但喀尔喀三汗与他不和。于是林丹汗率领所属10万之众，西奔库赫德尔苏，经呼和浩特，渡黄河到达鄂尔多斯。皇太极分兵三路穷追林丹汗41天，五月下旬进驻呼和浩特，得知林丹汗已南渡黄河而去。遂停止追击，经宣府、张家口返回。途中收拢了林丹汗所遗部众数万人。后金大军到达呼和浩特后，林丹汗在成吉思汗陵前举行庄严的仪式，宣称自己为全蒙古的"林丹巴图鲁汗"，遂带领察哈尔、鄂尔多斯部众，移动成吉思汗之陵，西渡黄河至大草滩。林丹汗在大草滩永固城一带拥众落帐，等待时机，重整旗鼓，准备东山再起。此时，一向坚决支持林丹汗事业的漠北喀尔喀却图台吉(土谢图汗部)，于1634年初，率所部4万之众，直奔大草滩与林丹汗会合。林丹汗和却图台吉通过红教的关系，与藏巴汗和白利(康区)土司顿月多吉建立了联系(金巴道尔吉《水晶鉴》，留金锁校注)。1634年夏，林丹汗不幸因病去世。林丹汗福金苏泰与其子额尔克孔果尔额哲率领察哈尔和鄂尔多斯部众自大草滩返回鄂尔多斯。喀尔喀却图台吉率部进入青海。林丹汗病故后，皇太极于1635年二月命多尔衮、岳托、萨哈廉、豪格领兵1万，前往鄂尔多斯寻找林丹汗子额哲。三月，多尔衮在西喇珠尔格地方遇到林丹汗的妻子囊囊，得知额哲所在地。四月二十日，渡过黄河，至托里图找到了额尔克孔果尔额哲。后来，后金统治者将察哈尔部安置于义州，分设左右翼察哈尔八旗，封林丹汗子额哲为亲王，并将皇女马喀塔格格嫁之，设都统和副都统统治察哈尔左右翼。1636年三月，漠南蒙古十六部49个大小领主齐聚沈阳，承认皇太极为汗，并奉上“博格达·彻辰汗”的尊号(****历史所《蒙古族通史》，民族出版社，2001年发行版)。同年，皇太极在盛京(沈阳)即位，改国号“清”，改元崇德。