big boss时代 cia为应付冷战时期的形势需要，组建一支以单独潜入手段完成特殊任务的作战部队，该部队命名为fox小队。表面上作为该部队的实战试验，fox参与贞洁行动。1964年8月24日贞洁行动开始。作为fox小队的一员，化名为naked snake（裸蛇），jack在汤姆上校（major tom）指挥下潜入tselinoyarsk救援索科洛夫（sokolov）。索科洛夫是**的科学家，研发了名为shagohod的秘密武器却害怕它的力量，打算转投美国。snake在行动中初次认识山猫（ocelot）。snake救出了索科洛夫，撤退途中索科洛夫却被the boss（首领）抢去，snake不敌被推下悬崖。眼镜蛇（cobra）部队成员重聚，作为移动的**发射装置开发出来的shagohod被沃尔金上校（volgin）用直升机运走，沃尔金却以头目送来的无后座力**发射装置发射了一枚美国制**以致事态变得严重。8月30日食蛇者行动开始，汤姆上校代号改为零（zero）。snake再次潜入tselinoyarsk，任务是救援索可洛夫，摧毁shagohod，并消灭眼镜蛇小队、沃尔金上校和the boss。snake结识了**派来的间谍夏娃（eva），以及后来登场的metal gear的发明者戈兰宁（granin）。snake从**中了解到“贤者们的遗产”的存在，沃尔金想要拿到这.big boss时代
cia为应付冷战时期的形势需要，组建一支以单独潜入手段完成特殊任务的作战部队，该部队命名为fox小队。表面上作为该部队的实战试验，fox参与贞洁行动。1964年8月24日贞洁行动开始。作为fox小队的一员，化名为naked snake（裸蛇），jack在汤姆上校（major tom）指挥下潜入tselinoyarsk救援索科洛夫（sokolov）。索科洛夫是**的科学家，研发了名为shagohod的秘密武器却害怕它的力量，打算转投美国。snake在行动中初次认识山猫（ocelot）。snake救出了索科洛夫，撤退途中索科洛夫却被the boss（首领）抢去，snake不敌被推下悬崖。眼镜蛇（cobra）部队成员重聚，作为移动的**发射装置开发出来的shagohod被沃尔金上校（volgin）用直升机运走，沃尔金却以头目送来的无后座力**发射装置发射了一枚美国制**以致事态变得严重。8月30日食蛇者行动开始，汤姆上校代号改为零（zero）。snake再次潜入tselinoyarsk，任务是救援索可洛夫，摧毁shagohod，并消灭眼镜蛇小队、沃尔金上校和the boss。snake结识了**派来的间谍夏娃（eva），以及后来登场的metal gear的发明者戈兰宁（granin）。snake从**中了解到“贤者们的遗产”的存在，沃尔金想要拿到这笔钱。经过一番波折，snake打败了眼镜蛇小队，消灭了shagohod和沃尔金，并在最后决战中杀死了恩师the boss。任务结束后，艾娃离开了他，留下的信件告诉他整个**其实是“贤者们”在幕后操纵，the boss不过是任务中发生意外，美国和**方面双方谈判决定牺牲她以证明美国清白。snake受到**嘉奖获得“big boss”（大首领）称号，却决定退隐离开fox小队。sokolov被fox小队的gene救回美国，同时带上了granin的metal gear设计图。gene获得了部分“贤者们的遗产”。cia获得metal gear设计图后命令sokolov开发新型武器，命名为metal gear。1970年代，**和美国的冷战军备竞争导致双方军费大增，双方签署和平协议并开始裁减军备。cia害怕**裁减军备后军力削弱会加快冷战结束而导致自己地位下降，打算将metal gear送给**以维护军事均衡。另一方面五角大楼由于cia的地位巩固以及战略上的一些小动作感到不满，希望削弱cia，便设计引发事端。1970年11月2日，big boss被叛变的fox小队抓获并囚禁在san hieronymo peninsula（实际上是五角大楼的计划），结识罗伊坎贝尔（roy campbell）。得知fox小队被指派到此执行任务，却叛变并获得了**的秘密武器metal gear。其首领gene是所谓的“successor”（继承者）计划的产物，目的在于培养the boss的继承者领导士兵。big boss俘虏美国及**士兵，组建自己的部队。行动中认识了el**a，**（也就是后来的gray fox）等人。el**a是贞洁行动中****的受害者，因此十分憎恨**，但同时又是一个双重性格的人，并有预知未来的能力。el**a的另一人格驾驶metal gear raxa攻击big boss，被big boss击毁。gene却说这不过是试验品，引发士兵自残后逃去。big boss潜入**井，从敌人**得知这次**是cia以及他们背后的“贤者们”策划的。在最后的控制室里，gene打算启动metal gear（icbmg）时被之前被认为已经死去了的el**a阻止，gene杀了她然后用备用开关启动了metal gear。最终big boss打败了gene，gene把用于建立“army he**en”的财产的胶卷交给了big boss，相信他日后会用到（后用于建设outer he**en）。但是icbmg的启动无法停止，big boss与士兵一起攻击火箭，令火箭发生故障偏离航道，icbmg在大气层中销毁。big boss回国，zero也解散了fox。1971年，基于fox**的行动特点，big boss成立猎狐犬（fox hound）部队。同年，big boss在越南河内救出艾娃。零和山猫铲除了美国方面的“贤者们”势力，利用部分“贤者们的遗产”成立了“爱国者”（the patriots）组织，以实践头目的理念。在山猫的极力推荐下big boss被引荐进入爱国者，其余的成员还有艾娃、技官（sigint）、**官（para-medic）。但big boss的理念和零日渐产生分歧。1972年，零执行“魔童计划”（les enfants terribles/恐るべき子供达计划），目的是制造一个big boss的代替品，solid snake（固蛇）、liquid snake（液蛇）和solidus snake（熔点蛇）即是这个计划的产物，其中固蛇和液蛇的母亲是eva。“魔童计划”加深了big boss和零的矛盾，big boss脱离“爱国者”，以他所理解的“the boss的理念”建立起“无国界之军”（msf）。零在big boss离开后，变得对一切都感到怀疑，不再相信别人。1974年，冷战因美苏两国的力量平衡而暂时平静下来。带领其组建的“无国界**”驻扎在哥伦比亚的big boss和米勒（miller），迎来了两位客人：自称是哥斯达黎加国联和平大学教授，代表**前来谈判的盖尔维兹（ramón gálvez mena），；以及名为帕姿（paz ortega andrade）的学生。盖尔维兹以类似"the boss"声音的录音为引诱，让big boss答应帮助他驱逐驻扎在哥斯达黎加的cia资助的部队。snake从fsln的阿曼达和奇可**得知敌人基地的位置及其中的“守护神”。潜入基地的snake遇上名为寇曼（coldman）的cia长官，以及二足步行兵器的开发者休伊（huey）博士。休伊告诉snake他开发的peacewalker是由ai控制的可移动核威胁力量，最大特点是可移动性以及完全理性的判断。但是peacewalker还有ai部分未完成。在帕姿的朋友西赛儿（cécile cosina caminades）的指引下，snake找到了ai的开发者奇爱博士（dr.strangelove）以及“the boss”-由奇爱博士开发，参照the boss的人格思考制造出的ai。一番恶斗后ai再次逃脱，big boss追踪ai至peacewalker的工场被抓住。后来他逃出来却发现peacewalker已经完成，未能击败peacewalker并让寇曼带着人质帕姿和peacewalker逃跑出国。big boss为阻止**发射来到尼加拉瓜的美军基地，发现这里被****控制着。站在他面前的寇曼声称将会给peacewalker输入假资料，让它误以为**发射**然后对**展开“反击”。盖尔维兹这时候突然出现，原来他实际的名字是vladimir alexandrovich zadornov，是kgb的间谍；他假意投降cia，利用美国的技术开发peacewalker然后据为己有。盖尔维兹命令帕姿**寇曼，但帕姿并不愿意这样做。盖尔维兹打伤寇曼，打算利用寇曼输入指令，将目标改为古巴，让全世界以为美国主动攻击**主义**并借机控制中美洲。fsln和无国界之军及时赶到将敌人一网打尽。被俘虏的寇曼临死前启动了peacewalker，将假资料发送到美军司令部让美国误以为**发射**，然后让忠于任务的peacewalker发动**。big boss击败了peacewalker却无法阻止其资料传送。这时模拟the boss的ai作出了**的决定，控制peacewalker走向大海以阻止信号传送。回到无国界之军基地的snake，多次出动将逃亡的盖尔维兹抓回，最后发现原来这是为了让帕姿将metal gear zeke改造成可以手动驾驶所制造的空档；而后帕姿驾驶metalgear zeke想要毁灭无国境之军，说出自己其实是“cipher”派来的间谍，姓名、身分通通是伪造的；之后与snake展开了战斗，最后帕姿战死坠海。零利用奇爱博士的ai技术开发出“爱国者”的ai系统，并逐渐渗透控制世界经济、**、军事等领域。big boss回到了美国，当上了猎狐犬（fox hound）的主管并暗中策划天外天国（outer he**en）。solid snake时代
某年，grey fox（灰狐）收养了一个在战争中失去亲人的小女孩，也就是后来的naomi hunter（直美·亨特）。1990年，为sas工作的liquid snake（利奎德·斯内克）在**执行摧毁移动的飞毛腿**发射器的任务，后宣称在任务中失踪。1994年，liquid snake返回美国。1995年，雇佣**建立的军事组织“outer he**en”（天外天国）逐渐浮**面，美国方面收到情报，“outer he**en”正在生产一种能改变世界战局的武器。fox hound（猎狐犬）负责潜入任务的特工grey fox（灰狐）在探索任务中失去联络，在big boss（大首领）指挥下fox hound成员solid snake（索利德·斯内克）负责继续追查该**，在基地中发现代号为metal gear tx-55（合金装备tx-55）的武器并发现幕后主脑正是big boss。最后他击败big boss，炸毁了metal gear tx-55并逃出“outer he**en”。1997年，中东发生军事叛乱，zanzibar（桑给巴尔岛）立国。1999年，kio marv（基奥·马尔夫）博士发明了炼制高度纯净的天然石油的微生物“oilix”，却被zanzibar**。solid snake在fox hound指挥官roy campbell（罗伊·坎贝尔）的指挥下潜入zanzibar，却发现zanzibar的领导者竟然是失踪了的grey fox。最后他打败了grey fox，metal gear d（合金装备d）和曾被认为在前次**中被击败的big boss。任务结束后solid snake退休居住在**斯加。big boss成为植物人，被zero“保管”起来。（在《合金装备4》推出之前，big boss被设定为已死，尸体被保存起来）。gray fox则被救回，身体被改造为机械忍者。2000年，liquid snake加入fox hound，成为地面作战分队的首领。naomi hunter加入fox hound的**疗小组，并开始了在士兵身上的dna理论研究和实验。2002年，开发中的metal gear gander，于南美进行演习时被由叛乱将军augustine eguabon指挥的gindra liberation front（简称gilif）抢走，开发人员被**并带回gindra，也就是以前的outer he**en（天外天国）。在roy campbell指挥下，snake潜入该基地，途中从幸存的delta force队员克丽丝·珍纳斯（chr** jenners）得知潜入部队已全部死亡，而叛乱的美军**black chambers也在基地，首领是viper。snake救出开发者jimmy wizard，得知metal gear已经装上了**。viper威胁美国**如果不放弃进攻就会用**攻击美国的任一城市。snake炸毁发电站打算阻止轨道炮发射，却被告知**依然可以发射，jimmy wizard也被炸死。snake潜入地下一百层，终于找到metal gear。这时viper现身，告诉snake：black chambers叛乱的原因是不想一直做fox hound的影子，希望能够帮cia夺回metal gear争回面子。打败viper后snake救回克丽丝，克丽丝告诉他她是陆军参谋长柏加下命令来的，目的是杀死将军和抹去一切和“project babel”相关的人和物。这时将军驾驶metal gear gander出现，告诉他们一切都是自己的安排。snake打败将军，将军临时前告诉他真相：outer he**en是美国**暗中援助的要塞**，非正式地提供反美军事力量。当年big boss失控，美国将outer he**en**。后来outer he**en成了gilif，美国想要让非洲出现反美势力，借战争派遣部队进驻，以维持冷战后美国的全球布局。这就是project bable。将军和陆军参谋长都是负责人。这时viper再次出现并打算发射**，原来metal gear还是太空中装有**的卫星的指挥站。幕后的间谍brian也被查出。最终snake击败viper，阻止了**的发射。2003年，dr.clark（即para-medic，fox-hound的**疗组长）死于想要逃跑的gray fox制造的实验室**中。naomi hunter掩盖了事实并接手dr.clark的工作。2005年2月底，shadow moses（影子摩西）岛上做演习的metal gear被叛乱的fox hound队员夺走，借以勒索美国**。solid snake再次被召回执行任务。snake潜入基地，认识了otacon和campbell的侄女（实际上是女儿）meryl（梅丽尔）。他发现军方秘密开发的是metal gear的最新型号rex。作为叛乱的主脑，liquid snake打算利用metal gear威胁**交出赎金和big...