第1话：使徒袭来
公元2015年，一个巨大的人型生物在日本登陆。出动的国联军，将那生物称作“使徒”，并予以猛烈地攻击，但就连最新的兵器“n2**”，亦只是在短时间内减缓了使徒的步伐。与此同时，一个名为碇真嗣的少年被其父源堂呼唤至第三新东京市地下的nerv 本部。碇真嗣和身为nerv司令官的父亲碇元渡有十年的时间都不在一起，面对许久不见的儿子，碇司官所说的只是∶“坐上eva。消极的少年拒绝接受命令，但当他见到一位身负重伤的少女即将乘坐初号机出击时，他改变了自己的决定。来袭使徒压倒性的强大，第三新东京市的地下空洞以及eva初号机这些sf方面的描写，使第一话显得多姿多彩。剧中采用了不少有电影效果的构图，相当有特色，但对于消极的14岁少年的性格，却十分难把握。制作组根据庵野总监督于95年3月的制作会议上的要求“这次的作品，一定要在最初就全力推出去”，都很认真地去执行。虽然这一话要与第二话合起来才是完整的一部分，但即便如此，一样造成了一定的冲击感。副标题是 angel attack。圣书中的使徒写作“messenger”，在这个场合的angel直译为守护神，也包含天使的意思。attack是攻击之意，而攻击来自何方不明。第2话：陌生的天花板
在没有受过特殊训练的情况下，真嗣就和eva 达成同步和使徒作战。射出后与第三使徒对峙的初号机，因为真嗣不熟悉操作，也无实战经验，在遭到使徒的攻击后活动停止。但在真嗣昏迷后初号机奇迹般地再启动，在失控的状态下，用压倒的战力将使徒击溃。面对冷漠的父子态度，葛城美里提出要真嗣与她同住的要求。14岁的自我封闭少年与29岁的单身美女的共同生活就此开始。美里对真嗣作战的成绩表示赞赏，但真嗣希望这话是出自另一人之口。这一集紧接前一集的内容，eva 初号机与使徒之间展开了战斗。比较引人注目的是可在瞬间见到的绝对领域，当时很多科幻迷称之为防御罩。在初号机暴走后，瞬间扭转的战况予人为之一震的感觉，这为以后的剧情打下了良好的铺垫。第一、二集合成一部作为了全篇的序章。副标题中的beast是兽的意思，大家看到暴走的eva初号机就可明白这个副题的含义。相同的感觉在以后的剧情中亦有出现。第3话：不响的电话
为了防范使徒再来，真嗣进行着eva的操作训练，同时也转学到第三新东京市的学校就读。在上课时，老师讲到第二次浩劫的历史**。可是同学们都不专心，在台下偷偷的玩用电脑网络聊天。真嗣被套出他是eva 驾驶员，在班上立刻成为受欢迎的人。但同班的铃原东治却对他大打出手，这是因为他的妹妹在eva 与使徒的战斗中受牵连而受伤。不一会，第四使徒来袭，真嗣将从避难所里出来观望的东治与剑介救入驾驶仓，并无视美里的撤退命令，用高振动粒子刀击退了使徒。真嗣的生活因为当了eva的驾驶员而起了巨大的变化，但在某些方面，他亦反而受到遣责，就象许多其他剧本中的为了人类而战的主人公们，他们的存在反而被人们视为威胁一样。第四使徒是被真嗣独立消灭的，但没人会认为他是什么热血沸腾的救世主，反而的，出于他消极的观念对所处环境进行的反抗，倒给人留下了深刻的印象，这种思维方式，相信很多人亦有同感吧。副标题中的transfer解释方式有很多，但在这里译为转校生最为合适。要表达的意义，是所处在一个陌生的集团中的那种不安感。第4话：下雨、出走以后
与第四使徒战斗胜利之后，真嗣并未意识到他战斗的意义，他离开家后，在第三新东京市的郊外，与相遇的剑介呆了一夜，第二日被nerv的保安谍报部带回。放弃 eva驾驶工作之后，他将被护送回原住处。听毕剑介对真嗣心理的见解，美里急忙赶往车站去送行，列车已缓缓驶离车站，但月台上仍有一位少年的身影。这一集没有什么激烈的战斗场面，完全是用来描绘真嗣心的轨迹的一话。希望别人关心，但又制造一种让人无法靠近的性格，其矛盾演变至最后，就会开始讨厌自己。出走，亦只是这一心理的一个小小的体现吧。在这一话中，为了描写真嗣的空虚，背景从都市到自然景象，都费了不少精力。副标题中的hedgehog是指刺猬，dilemma 意为困境。刺猬希望给予朋友们温暖，但它越是靠近越会伤害别人。第5话：丽、心的背面
绷带少女绫波丽是eva零号机的专属驾驶员。她在真嗣调来第三新东京市的三周前的零号机启动实验中，因事故受伤。在学校，她无口、无心、无表情的性格使得没有人愿意与她交往。但真嗣却见到她微笑着与自己父亲源堂交谈，于是对丽产生了兴趣。同时，第五使徒袭来，刚被射出的初号机就遭到了高热加粒子炮的攻击。最受欢迎的丽，有关她的剧情终于展开了，开场时就身受重伤，全身包**绷带。在真嗣无法理解的父亲面前，她却意外地露出笑颜。脏乱无摆设的房间，完全不象是一个女孩子的。还有桌上的那副眼镜，应该不会是丽的…她的一切，似乎都是谜，如此一个玩偶般的角色，竟然位于全日本动画千万女性角色的首位，实在有些不可思议。副标题是rei ⅰ，这是有关她的几部剧本的第一个。第6话：决战在第三新东京市
受到加粒子炮攻击的初号机，所幸未伤至要害，但真嗣却对战斗开始胆怯。另一方，使徒正在使用能量钻向nerv本部的位置展开攻击。面对持有自动防御系统的使徒，美里提出了超长距离射击的提案，并取名为“八岛作战”。数小时后，日本列岛全土的能源，集束于战自的阳电子炮内，**手为真嗣，丽驾驶零号机执行防御任务。于是，使徒加粒子炮与阳电子炮的两束热能交错飞过，使徒被击坠，而丽挡在了真嗣的面前。这一话基本围绕对第五使徒的攻防战展开。在剧中的“八岛作战”来自于屋岛合战中，那须与一从岸上射落船上平氏的扇子这一故事。其次自古以来，日本列岛就有“八岛”（yashima）的称法，故由日本全土收集来的集束化能源射击所包含的两个意义，决定了这个作战计划的名称。当然，最后的场面中真嗣将丽从融化了的零号机里救出后，丽说：“对不起，这种时刻，我不知道该用怎样的表情面对你。而真嗣的台词是“我认为微笑就可以了”这段，在片中起到了相当好的平衡作用，是给人留下印象较深的部分。第7话：人类制造的东西
由第二次浩劫引发的世界经济的混乱与崩溃，至2015年亦无法完全恢复。此时的日本经济。由于水位上涨，平野被淹没，工业生产的确是遭到了致命的打击。然而，国土复兴的工程所消耗的物资，简直就是天文数字，所以日本**与民间企业，一直将吞食了大量资产的对使徒军事企业视为大敌，故始终都在寻找可替代nerv的廉价企业。除了**外，也有许多其他组织看不惯nerv的（如第11话原因不明的大停电）。由于eva对付使徒的效率不彰，而且常常造成重大的”灾害”，为此民间团体也推出了迎击使徒专用无人驾驶机器人ja。美里与律子也受到了邀请，律子对ja的设计及性能提出质疑，但是反被嘲笑eva 的功能不佳，像个大玩具一样。美里猛踢衣柜出气，律子则静静的用打火机把说明书烧掉。在宴会后的试运转中，ja突然陷入了操作不能的状态，美里单身冒着ja炉心熔解的危险，进入ja内部关闭系统，但操作系统的密码，已被人删改。幸而在初号机的配合下，终于推出了ja的操作棒才幸免于难。这场看似意外的**，美里心里也很明白，ja的暴走及被删改的程度，都是nerv所为。赤木律子之所以会放心的让葛城去阻止ja，是因为她确信ja会在**前恢复正常，因为结尾她说：“除了葛城一尉的行动外，一切都照剧本进行。也就是说，没有葛城去阻止的话，ja一样会停止。葛城自己也说：“奇迹是被某人准备好的。第8话：**的来日
从德国的nerv第三支部，送来了eva二号机。在担负护送任务的太平洋舰队，美里与真嗣一行初次面对第二适格者**，此外美里以往的恋人加持良治也同乘返回日本。途中，舰队遭到水中的第六使徒的攻击，**将真嗣拉入二号机驾驶舱后一同出击，但装配着无法进行水下攻击的b型装甲的二号机，很快就被使徒吞入**。美里提出零距离射击计划，众人**困境并将使徒歼灭。次日，**亦转入了真嗣所在的班。第八、九话设计稿的工作，庵野监督请来了因担任《gamera、大怪兽空中决战》的特技监督而闻名的通口真嗣来执任，希望近几集能**数集来营造成的沉闷气氛，搞出比较轻快的作品。通口氏原在《兰宝石之谜》的时期就与庵野监督合作过，他对于**类型的性格亦比较有见解。最后，如其所望，本集成为了eva 系列中最为轻快的一集，而且有自己独特的色彩。值得一提的是，负责**配音的宫村优子，为了这个角色还特地去上了德语的补习班。第9话：心在瞬间重叠了
刚到班上不久的**，成为了最受欢迎的人物。不过**对中学生没兴趣的样子，情书都被狠狠地踩一脚（便鞋上还要写名字？丽实在是对周遭的事陌不关心，**挡到她的光线，她竟只有移开一点，头都不抬一下，**以挑衅的语气跟丽说：“好好相处吧。丽竟然回答：“为什么？“有命令我就会去做。在纪伊半岛海湾出现了持有分离合体功能的第七使徒，配合不协调的**与真嗣，立即遭到戏剧般的攻击。经分析，只有同时击中分离的两个使徒核才能消灭第七使徒。于是，美里将**亦领回家来与真嗣同住，并进行协调统一的特训。数日后在战场上，需要在62秒的音乐结束之前击溃使徒，两人配合完璧的“舞蹈”坚持至最后数秒时崩溃，但使徒已被消灭。这一话就是有名的62秒战争，进行的节奏很快，音乐性很强，相当的精彩。与使徒作战时的bgm（背景音乐）已收入原创音乐cd的vol.2里。跟随音乐，初号机与二号机舞蹈般的攻击感觉十分理想。此外，迎击要塞的系统与兵器也展现了不少，科幻迷也为之欣喜。在tv播放之前，曾作过录像处理，适当调整了时间速度，使临场感有所增加。第10话：熔岩潜行者
在浅见火山熔岩中发现了第八使徒的幼体。由**来执行首次使徒捕获作战。二号机装备了耐热耐压的d型装备后潜入熔岩一千米以下成功地捕捉了使徒的幼体，但在上升过程中，幼体开始急速乳孵化，作战计划不得不有捕捉更改为歼灭。在熔岩中苦战的**受到真嗣提出有关“热膨胀”原理的问题的启发，利用冷却液成功地消灭了使徒。对于谜之敌“使徒”的生态描写，在这个剧本中是很有特色的。在高温高压的恶劣环境中，使徒幼体的外形，看上去就象是人类的胎儿以及由加持从德国带回来的“亚当最初形态”。孵化后，其外形与生态都起了很大改观，除了在熔岩中高速移动外，亦可张开口！如果将以后的第十三使徒拿来共同分析的话，猜想使徒的进化状况与其所处的环境是有关的，再一个例子就是第六使徒，其外型如同古生代的鱼类。在测定使徒时画面上所写的“analys** pattern．blood type．blue”一文出自庵野监督所敬爱的冈本喜八监督的科幻电影《蓝色圣诞节》（blood type blus）。eva的“更衣室”里居然还挂著巨大的“衣架”，机器设定真是到处都是恶趣味。第11话：在静止的黑暗中
在一次实验中，nerv本部的电力供应忽然中断，仅有的后备电力被用于维持magi系统。正当nerv处于一片混乱时，第九使徒由海岸登陆。与第三新东京市内的真嗣、丽与**，听到国联的警报后，努力寻找可到nerv的通道。同时，元渡他们用自己的手为eva的发进作好了准备。三机发进后，联合作战成功地击毁使徒。这次剧本所主要描写的，是受到来自人类阴谋破坏而陷入危机的nerv，与第七话有一定相呼应之处。作画系有不少新手加入，也尝试着加入一些与eva 系列不同的作画手法。导入部分从nerv职员们的日常生活开始，强调了作品的生活氛围。之后，对于日常（可使用电器的状态）与非日常（不能使用电器的状态）的描写，暗示人类社会是建立在脆弱的基础之上。第12话：奇迹的价值是
美里被晋升为三佐，剑介他们特意搞了聚会庆祝。这时，在卫星轨道上出现了迄今为之最大的一个使徒，它的本体，在探测到nerv的位置后照准加速坠落下来。在源堂不在的情况下，美里制订了用eva三机共同利用a·t·field抵挡的计划并取得成功。为此，源堂从南极发回了贺电，真嗣也因此找到了“乘坐eva战斗的理由”。好不容易打赢了第九使徒，美里本来说要带三个小孩吃大餐，可惜天性懒散的她没钱了，最后被拖去吃路边摊拉面。这种安排其实比她们吃大餐要温馨得多，第一次看到丽与她们交际（吃大餐的话她就不去，因为她讨厌肉）。从这一话里，可以发现“第二次浩劫”的可疑之处，而美里的过去，也随之慢慢地展现在观众面前。第13话：使徒侵入
nerv本部在进行模拟体测试实验时，于蛋白壁上发现异常，经magi判明为细菌规格的第十一使徒。该使徒能够急速**、增殖，控制模拟体后开始侵蚀magi系统，并提速nerv**。对此，律子进入magi尚未被侵蚀的casper·3，依靠她母亲的残存记忆为使徒写入了自灭促进程序，之后，使徒歼灭。这一...