合众联盟（第一季）
bw01.前往合众地方!捷克罗姆的身影!（修帝、艾莉丝、红豆杉博士登场）
bw02.艾莉丝与牙牙!（**原有神奇宝贝寄放在本部，武藏收服滚滚蝙蝠，小智收服豆豆鸽）
bw03.水水獭!黑眼鳄!危在旦夕!（小智得到水水獭）
bw04.对战俱乐部!神秘的神奇宝贝现身!（小智得到暖暖猪）
bw05.三曜道馆!vs爆香猴、冷水猴、花椰猴!（天桐登场）
bw06.梦的遗址!食梦梦和梦梦蚀!（小智得到挑战徽章，真菰博士登场，艾莉丝与天桐加入）
bw07.藤藤蛇·迷人收服!（小智收服藤藤蛇）
bw08.火红不倒翁与达摩狒狒!钟塔的秘密!bw09.蜈蚣王发飙!救出牙牙!bw10.劲敌对战!强敌轻飘飘!bw11.石居蟹!取回自己的家吧!（天桐得到石居蟹）
bw12.破破袋战队与秘密基地!（小智得到蛋）
bw13.泡沫栗鼠有洁癖!（白露登场）
bw14.七宝市!博物馆大冒险!bw15.七宝道馆赛!vs道馆训练家·芦荟!bw16.再次挑战七宝道馆!新绝招爆发!（小智得到基础徽章）
bw17.从蛋中孵出的小霸王!（小智的蛋孵化成滑头小子）
bw18.矢车森林!虫宝包与亚堤!（小智收服虫宝包)
bw19.酒侍对决!石居蟹vs双刃丸!（赤霞珠登场）
bw20.皮卡丘vs黑眼鳄vs鸭宝宝!bw21.天之箭桥与歌德小姐!bw22.飞云市!百足蜈蚣恐慌!（豆豆鸽进化成波波鸽）
bw23.飞云道馆赛!纯情之心的虫系神奇宝贝对战!（小智得到甲虫徽章，虫宝包进化成宝包茧，小次郎得到哭哭面具）
bw24.钓鱼酒侍!天桐登场!bw25.要小心可爱脸蛋!被导电飞鼠电到发麻!（艾莉丝得到导电飞鼠）
bw26.导电飞鼠vs藤藤蛇!交换伏特大混乱!bw27.烛光灵大宅的恐～怖故事!bw28.通往龙系**之道!牙牙vs赤面龙!bw29.消失的扇贝贝!水水獭最大的危机!（肯尼洋登场）
bw30.恋爱中的木棉球乘风飞翔!bw31.小灰怪与不明飞行物体!bw32.劲敌对战!迷你冰、搬运小匠参战!bw33.蓝蟾蜍、泥巴鱼!水边的战斗!（小智收服蓝蟾蜍，天桐收服泥巴鱼）
bw34.龙之破坏者登场!艾莉丝与龙头地鼠!（蓝葛雷登场）
bw35.石丸子!发射光泽电炮吧!（小智收服石丸子）
bw36.酒侍侦探天桐!差不多娃娃失踪事件!bw37.化石复活!古代怪鸟始祖大鸟!bw38.索罗亚电影!神奇宝贝骑士传说!bw39.全体集合!东·乔治对战!bw40.激战东·乔治对战!藤藤蛇vs驹刀小兵!bw41.白热化的东·乔治对战!导电飞鼠vs打击鬼!bw42.决战东·乔治对战!小智对艾莉丝!bw43.交涉喵·喵喵!头巾混混说服作战!bw44.要小心扒手猫!喵喵与水水獭!bw45.大宇怪与双卵细胞球与梦境小偷!bw46.交涉喵·喵喵!突破冻原熊的森林!bw47.疾奔!对战地下铁!（前篇）
bw48.疾奔!对战地下铁!（后篇）
bw49.道馆训练家是超级模特儿!小菊儿登场!bw50.雷文道馆!华丽的**对战!（小智得到伏特徽章）
bw51.小智、天桐对地下铁总控官!bw52.小智对冠军·阿戴克!（阿戴克登场）
bw53.前往彩虹另一头！街头沙铃的音乐剧!bw54.芽吹鹿!春夏秋冬全部到齐!bw55.滑头小子与任性的哥德宝宝!bw56.艾莉丝与单首龙!抚养屋修行!bw57.敏捷☆战士对几何雪男!bw58.天桐与伯特，兄弟对决!爆香猴vs花椰猴!bw59.龙卷云vs雷电云vs土地云!（前篇）
bw60.龙卷云vs雷电云vs土地云!（后篇）
bw61.地底的道馆赛!vs菊老大!（石丸子进化成地幔岩，小智得到颤抖徽章）
bw62.电电虫、电蜘蛛!电石洞穴!（石居蟹进化成岩殿居蟹）
bw63.通讯交换进化!骑士蜗牛和敏捷虫!bw64.黑英雄的遗迹!象征鸟与死神棺!bw65.二对二对战!皮卡丘·混混鳄vs蜈蚣王·蟾蜍王!（小智收服混混鳄）
bw66.爆爆头go!爆爆头水牛no!bw67.吹寄道馆的空想对战!挑战者天桐!bw68.吹寄道馆!vs风露 空中决战!（波波鸽进化成轰隆雉鸡，小智得到喷射徽章）
bw69.突破难关!登上天空之塔!bw70.东·乔治格斗大会开幕!滑头小子对花椰猿!bw71.不断继续吧东·乔治格斗大会!赤面龙对劈斩司令!bw72.激战东·乔治格斗大会!劈斩司令对炎武王!bw73.决战东·乔治格斗大会!投射鬼对打击鬼!bw74.救出牙牙!铁蚁的巢穴!（宝包茧进化成保母虫）
bw75.罗斯山的激战!肋骨海龟的奇迹（前篇）
bw76.罗斯山的激战!肋骨海龟的奇迹（后篇）
bw77.炎之回忆!暖暖猪vs炎武王!（暖暖猪进化成炒炒猪）
bw78.哈奇库登场!火神虫的圣山!bw79.雪花道馆赛!冰之对战场地!（小智得到冰柱徽章）
bw80.神奇宝贝酒侍对决!品评对战!bw81.种子铁球研究所!艾莉丝与双倍多多冰!bw82.电影对决!合众防卫队 出击!bw83.激战立涌道馆!vs霍米加!（前篇）
bw84.激战立涌道馆!vs霍米加!（后篇）（小智得到毒性徽章）
合众联盟（第二季）
bw85.歌唱吧，美洛耶塔爱的旋律!bw86.波加曼vs花椰猴
华丽的对战!（小光归队）
bw87.大岩蛇岛野外求生!bw88.酒侍侦探天桐!消失的喷嚏熊之谜!bw89.艾莉丝与小霸王快龙!（艾莉丝收服快龙）
bw90.青少年杯开幕!快龙对冻原熊!bw91.力量对决!艾莉丝对小光!bw92.小智、艾莉丝、修帝!最后的对决!（混混鳄进化成**鳄）
bw93.道别与相遇的青少年杯!（小光离队）
bw94.青海波道馆赛!巨翅飞鱼vs大剑鬼!bw95.神奇宝贝幼儿园大骚动!毛头小鹰与**小子
bw96.美洛耶塔与海底的神殿!bw97.灵兽型态合力进击！合众最大的危机!bw98.世界上第一华丽的神奇宝贝！奇诺栗鼠对藤藤蛇!bw99.天空和大地的双打对战!bw100.艾莉丝，回到龙之乡!bw101.双龙道馆，艾莉丝对夏卡!bw102.伊布队出动!神奇宝贝救援队!bw103.开幕!合众联盟·桧垣大会!小智对修帝!bw104.热斗!从劲敌对战中胜出!bw105.牙牙迷路走失了!bw106.打击鬼登场!小智对肯尼洋!bw107.小智对虎彻!秘密武器三头龙!bw108.决战合众联盟!皮卡丘对路卡利欧!（小智止步桧垣大会前八强）
bw109.红豆杉研究所！展开新旅行!bw110.朋友…他的名字是n!bw111.新道馆训练家!黑连!bw112.阿克罗玛vs帅哥！电浆团的阴谋!bw113.雾之算木牧场！电龙的灯光！bw114.n再度现身！拯救勇士鹰作战！bw115.紧急出动！神奇宝贝海岸救援队
bw116.燃烧吧！喷火龙！vs快龙！（小智的喷火龙归队，轰隆雉鸡寄放在大木研究所）
bw117.电浆团的野心！**纵的神奇宝贝!bw118.n的秘密…在雾的远方！bw119.**对电浆团！喵喵与阿克罗玛!bw120.白色遗迹！小智对n!bw121.电浆团袭击！复活的仪式!bw122.雷希拉姆对n！理想和真实的那一方!bw123.再见了合众！新的乘船之旅！（小智在红豆杉研究所的神奇宝贝被送回大木研究所）
bw124.甘甜蜂蜜充满危险！bw125.酒侍侦探天桐！大海原的密室!bw126.再见水水獭!通往扇贝贝王之道
bw127.幻影之岛！雾中的索罗亚克!bw128.洛托姆vs大木博士！bw129.德科罗拉群岛的海贼王！bw130.小智与巴大蝴！直到再会的那一天!bw131.小智与艾莉丝绝交!离别的道路
bw132.向基拉祈许愿吧！七日间的奇迹!bw133.发光的飞碟！大宇怪之城!bw134.大堇登场！エリキテル与ゴーゴート!bw135.宝藏之谜！无人岛冒险！bw136.小桩与艾莉丝！异色的赤面龙！bw137.オンバーン登场！彗星与勇者的传说!（8月15日）
bw138.go go ゴーゴート！（8月22日）
bw139.导电飞鼠，加入**！（9月5日）
bw140.天桐vs冰之挑战者 三曜道馆的危机！（9月12日）
bw141超级愿望！直到再会的那一天！bw142我的梦想、神奇宝贝**！真实集数一共只有142集，
因东日本大地震的海啸和核泄漏事故，部分原定播出内容受影响。原第23、24集的《**vs等离子团团!（前、后篇）》不再播出（在n篇章重新演绎），原26集的《钓鱼酒侍!天桐登场!延迟在原bw39（现bw36）之后播出，内容也有少许改动，所以变成bw37。因上述原因，集数编号不能与网上视频对应，所以请自行增加集数2或3集，然后再观看。本排法是根据日本神奇宝贝官网公布的官方排法，请勿自行修改。本部的播出进程中，也播出过《神奇宝贝钻石&珍珠》的特别篇，但由于并不属于超级愿望篇，因此没有计入本部集数。如有疑问欢迎继续追问，如有雷同请查看右上方回答时间