1996年（001~042）
001 云霄飞车**事件☆
002 社长千金诱拐事件☆
003 偶像密室**事件
004 大都会暗号地图事件☆
005 新干线大**事件
006 情人节**事件
007 每月一件礼物威胁事件
008 美术馆**事件
009 天下一夜祭**事件
010 足球选手恐吓事件
011 钢琴奏鸣曲月光**事件☆
012 步美**事件☆
013 奇怪的寻亲**事件
014 谜样的讯息**事件
015 消失的尸体**事件
016 古董收藏家**事件
017 百货公司挟持事件
018 六月新娘**事件
019 电梯**事件
020 鬼屋**事件
021 电视剧外景队**事件
022 豪华客轮连续**事件(前篇)
023 豪华客轮连续**事件(后篇)
024 丧失记忆的美女事件
025 真假人质绑票事件
026 小五郎同学会**事件(前篇)
027 小五郎同学会**事件(后篇)
028 爱犬约翰**事件
029 电脑**事件
030 不在场证明**事件
031 电视台**事件
032 咖啡店**事件
033 侦探团生还事件
034 山庄绷带怪人**事件(前篇)
035 山庄绷带怪人**事件(后篇)
036 周一晚上七点半**事件
037 仙人掌花**事件
038 红**火祭**事件
039 优胜锦旗被割事件
040 企业家千金**事件(前篇)
041 企业家千金**事件(后篇)
042 卡拉ok歌厅**事件
1997年（043~085）
043 江户川柯南诱拐事件
044 堀田三兄弟**事件
045 敷面膜**事件
046 雪山山庄**事件
047 体育俱乐部**事件
048 外交官**事件(前篇)
049 外交官**事件(后篇)
050 图书馆**事件
051 高尔夫练习场**事件
052 雾天狗传说**事件☆
053 迷样的凶器**事件
054 电玩公司**事件
055 列车圈套**事件
056 清洁公司**事件
057 福尔摩斯迷**事件(前篇)
058 福尔摩斯迷**事件(后篇)
059 第一次购物**事件
060 插画画家**事件
061 幽灵船**事件(前篇)
062 幽灵船**事件(后篇)
063 大怪兽哥美拉**事件
064 第三个指纹**事件
065 螃蟹与鲸鱼**事件
066 夜路**事件
067 舞台女演员**事件
068 暗夜公爵**事件(事件篇)☆
069 暗夜公爵**事件(疑惑篇)☆
070 暗夜公爵**事件(解决篇)☆
071 米花之狼**事件
072 三胞胎别墅**事件
073 少年侦探团遇难事件
074 死神阵内**事件
075 金融公司社长**事件
076 柯南vs怪盗基德☆
077 名门连续惨死事件(前篇)
078 名门连续惨死事件(后篇)
079 银行强盗**事件
080 流浪画家**事件
081 当红艺人**事件(前篇)
082当红艺人**事件(后篇)
083 综合医院**事件
084 滑雪别墅**事件(前篇)
085 滑雪别墅**事件(后篇)
1998年（086~128）
086 诱拐现场特定事件
087 白鹤报恩**事件
088 德修拉别墅**事件(前篇)
089 德修拉别墅**事件(后篇)
090 花香**事件
091 抢匪住院事件
092 恐怖的登山**事件(前篇)
093 恐怖的登山**事件(后篇)
094 雪女传说**事件
095 小五郎约会**事件
096 走投无路的名侦探！连续两大**事件
097 离别美酒**事件
098 名陶艺家**事件(前篇)
099 名陶艺家**事件(后篇)
100 初恋情人回忆事件(前篇)
101 初恋情人回忆事件(后篇)
102 古装演员**事件(前篇)
103 古装演员**事件(后篇)
104 盗贼集团别墅事件(前篇)
105 盗贼集团别墅事件(后篇)
106 新闻照片**事件
107 鼹鼠星人之谜事件(前篇)
108 鼹鼠星人之谜事件(后篇)
109 侦探团大追踪事件
110 料理教室**事件(前篇)
111 料理教室**事件(后篇)
112 帝丹小学七大离奇事件
113 白色海滩**事件
114 有氧潜水**事件(前篇)
115 有氧潜水**事件(后篇)
116 推理小说家失踪事件(前篇)
117 推理小说家失踪事件(后篇)
118 浪花连续**事件☆
119 假面超人**事件
120 蜜蜂鸡尾酒**事件
121 浴室密室事件(前篇)
122 浴室密室事件(后篇)
123 天气预报小姐诱拐事件
124 神秘的**者**事件(前篇)
125 神秘的**者**事件(后篇)
126 旅行戏团**事件(前篇)
127 旅行戏团**事件(后篇
128 黑暗组织10亿元**事件
1999年（129~173）
129 来自黑暗组织的女子 大学教授**事件
130 竞技场无差别胁迫事件(前篇)
131 竞技场无差别胁迫事件(后篇)
132 魔术爱好者**事件(事件篇)
133 魔术爱好者**事件(疑惑篇)
134 魔术爱好者**事件(解决篇)
135 消失的凶器搜索事件
136 青色古堡探索事件(前篇)
137 青色古堡探索事件(后篇)
138 最后上映的**事件(前篇)
139 最后上映的**事件(后篇)
140 sos！步美传达的讯息
141 结婚前夜的密室事件(前篇)
142 结婚前夜的密室事件(后篇)
143 疑惑的天体观测
144 上野出发北斗星3号(前篇)
145 上野出发北斗星3号(后篇)
146 本厅刑事恋爱物语(前篇)
147 本厅刑事恋爱物语(后篇)
148 路面电车急刹车事件
149 游乐园蹦极事件
150 汽车**事件的真相(前篇)
151 汽车**事件的真相(后篇)
152 神秘老人失踪事件
153 园子的夏日海滩冒险物语(前篇)
154 园子的夏日海滩冒险物语(后篇)
155 水中的钥匙密室事件
156 本厅刑事恋爱物语2(前篇)
157 本厅刑事恋爱物语2(后篇)
158 沉默的环状线
159 奇怪的五重塔传说(前篇)
160 奇怪的五重塔传说(后篇)
161 流水亭流出的杀意
162 飞天密室 工藤新一最初的事件☆
163 月与星与太阳的秘密(前篇)
164 月与星与太阳的秘密(后篇)
165 少年侦探队消失事件
166 鸟取县蜘蛛屋的怪事(事件篇)☆
167 鸟取县蜘蛛屋的怪事(疑惑篇)☆
168 鸟取县蜘蛛屋的怪事(解决篇)☆
169 维纳斯之吻
170 黑暗之中的死角(前篇)
171 黑暗之中的死角(后篇)
172 复活的死亡讯息(前篇)
173 复活的死亡讯息(后篇)
2000年（174~218）
174 二十年的杀意 圣佛尼号连续**事件
175 被杀了四次的男人
176 与黑衣组织的再会(灰原篇)☆
177 与黑衣组织的再会(柯南篇)☆
178 与黑衣组织的再会(解决篇)☆
179 咖啡店货车闯入事件
180 红色杀意的夜想曲(前篇)
181 红色杀意的夜想曲(后篇)
182 九个门大搜索
183 危险的处方笺
184 诅咒的假面的冷笑☆
185 被**的名侦探(前篇)
186 被**的名侦探(后篇)
187 回响在黑暗中的的神秘枪声
188 危命的复活 洞窟中的侦探团☆
189 危命的复活 负伤的名侦探
190 危命的复活 第三种选择
191 危命的复活 黑衣骑士
192 危命的复活 新一回来了
193 危命的复活 约定的场所
194 意味深长的八音盒(前篇)
195 意味深长的八音盒(后篇)
196 看不见的凶器 小兰的初次推理
197 超级汽车**事件(前篇)
198 超级汽车**事件(后篇)
199 嫌疑犯毛利小五郎(前篇)
200 嫌疑犯毛利小五郎(后篇)
201 第十位乘客(前篇)
202 第十位乘客(后篇)
203 伊卡路斯的黑色之翼(前篇)
204 伊卡路斯的黑色之翼(后篇)
205 本厅刑事恋爱物语3(前篇)
206 本厅刑事恋爱物语3(后篇)
207 无与伦比的推理
208 迷宫的入口 巨大神像的愤怒☆
209 龙神山的坠落事件
210 五彩传说的水中宫殿（前篇）
211 五彩传说的水中宫殿（后篇）
212 蘑菇、山熊和侦探队（前篇）
213 蘑菇、山熊和侦探队（后篇）
214 怀古饭店的神秘事件
215 复仇海滩(前篇)
216 复仇海滩(后篇)
217 被封印的目暮的秘密(前篇)
218 被封印的目暮的秘密(后篇)
2001年（219~262）
219 被召集的名侦探！工藤新一vs怪盗基德☆
220 满口谎言的委托人(前篇)
221 满口谎言的委托人(后篇)
222 人鱼失踪记(事件篇)☆
223 人鱼失踪记(推理篇)☆
224 人鱼失踪记(解决篇)☆
225 生意兴隆的秘密
226 战斗游戏的陷阱(前篇)
227 战斗游戏的陷阱(后篇)
228 暗藏杀机的陶艺教室(前篇)
229 暗藏杀机的陶艺教室(后篇)
230 谜一样的乘客(前篇)
231 谜一样的乘客(后篇)
232 公寓坠落事件
233 无法消失的证据(前篇)
234 无法消失的证据(后篇)
235 酒窖密室事件
236 南纪白滨的神秘之旅(前篇)
237 南纪白滨的神秘之旅(后篇)
238 大阪的3个k事件(前篇)
239 大阪的3个k事件(后篇)
240 新干线护送事件(前篇)
241 新干线护送事件(后篇)
242 元太少年的灾难
243 毛利小五郎的冒充者(前篇)
244 毛利小五郎的冒充者(后篇)
245 向日葵馆的枪声
246 陷入网中的谜团(前篇)
247 陷入网中的谜团(后篇)
248 治愈之森林的不在场证明
249 偶像们的秘密(前篇)
250 偶像们的秘密(后篇)
251 ok牧场的悲剧
252 图画中的**犯
253 本厅刑事恋爱物语4(前篇)
254 本厅刑事恋爱物语4(后篇)
255 松江玉造连句十四次定胜负(前篇)
256 松江玉造连句十四次定胜负(后篇)
257 世间奇妙的天罚
258 来自芝加哥的男人(前篇)
259 来自芝加哥的男人(后篇）
260 摇晃的餐馆
261 雪夜的恐怖传说(前篇)
262 雪夜的恐怖传说(后篇)
2002年（263~303）
263 大阪双重谜团 浪花剑士与太阁之城
264 法庭的对决 妃vs小五郎(前篇)
265 法庭的对决 妃vs小五郎(后篇)
266 情人节的真相(事件篇)
267 情人节的真相(推理篇)
268 情人节的真相(解决篇)
269 犯罪的遗物(前篇)
270 犯罪的遗物(后篇)
271 急忙掩饰的忽略(前篇)
272 急忙掩饰的忽略(后篇)
273 猜谜婆婆失踪事件
274 幽灵屋的真相(前篇)
275 幽灵屋的真相(后篇)
276 **手册丢失事件
277 英语教师vs西部名侦探(前篇)
278 英语教师vs西部名侦探(后篇）
279 迷宫的阴暗(前篇)
280 迷宫的阴暗(后篇)
281 年幼的目击者
282 水流石庭的玄机(前篇)
283 水流石庭的玄机(后篇)
284 中华街 雨中的似曾相识(前篇)
285 中华街 雨中的似曾相识(后篇)
286 工藤新一纽约事件(事件篇)☆
287 工藤新一纽约事件(推理篇)☆
288 工藤新一纽约事件(解决篇)☆
289 迷惘森林中的光彦(前篇)
290 迷惘森林中的光彦(后篇)
291 孤岛的公主与龙宫城(事件篇)
292 孤岛的公主与龙宫城(追求篇)
293 孤岛的公主与龙宫城(解决篇)
294 爱与决心的粉碎(前篇)
295 爱与决心的粉碎(后篇）
296 屋形船 震惊的钓鱼
297 法庭的对决ii 妃vs九条(前篇)
298 法庭的对决ii 妃vs九条(后篇)
299 友情与杀意的关门海峡(前篇)
300 友情与杀意的关门海峡(后篇)
301 恶意与圣者的行进(前篇)
302 恶意与圣者的行进(后篇)
303 能归来的受害者
2003年（304~344）
304 震动的警视厅 1200万名人质☆
305 看不见的嫌疑犯(前篇)
306 看不见的嫌疑犯(后篇)
307 无声的证词(前篇)
308 无声的证词(后篇)
309 同黑暗组织的接触(交涉篇)☆
310 同黑暗组织的接触(追踪篇)☆
311 同黑暗组织的接触(决死篇)☆
312 夕阳染红的女儿节人偶(前篇)
313 夕阳染红的女儿节人偶(后篇)
314 栏杆损坏的展望台
315 阳光普照的地方
316 被玷污的蒙面英雄(前篇)
317 被玷污的蒙面英雄(后篇)
318 幸运的雪茄盒(前篇)
319 幸运的雪茄盒(后篇)
320 不在场证明的隐术
321 消失的**逃逸车(前篇)
322 消失的**逃逸车(后篇)
323 服部平次一筹莫展(前篇)
324 服部平次一筹莫展(后篇)
325 火焰中的红马(事件篇)
326 火焰中的红马(搜索篇)
327 火焰中的红马(解决篇)
328 生日葡萄酒之谜
329 金钱买不到的友情(前篇)
330 金钱买不到的友情(后篇)
331 疑惑的辣味咖喱饭(前篇)
332 疑惑的辣味咖喱饭(后篇)
333 相似的两位公主(前篇)
334 相似的两位公主(后篇)
335 东都现象所的秘密(前篇)
336 东都现象所的秘密(后篇)
337 坠落事件背后...