在后期某章中，赛巴斯提安与基曼共同行动时，赛巴斯提安受到鲁维克的影响，突变成为怪物，攻击基曼。而基曼立刻反击，一枪命中赛巴斯提安。瞬间，赛巴斯提安陷入了另一段画面—躺在实验浴缸中，可以看见形似基曼的人身后走出了一个形式赛巴斯提安的人，然后被其一枪命中。随后，在精神世界中的赛巴斯提安恢复正常并醒了过来。首先，我们来整理一下这游戏的设定，通过游戏中的文档以及通关后的模型模式中的一些设定解释，可以知道，我们游戏所处的舞台正是鲁维克所主导的在一个叫stem系统中的精神世界。而stem系统的功能是让人类的精神连接，从而达成同步，意识交换甚至复写—如果能够稳定运行的话可以成为一种让某个人类靠着让精神寄生于他人的身体而达成永生的系统。然而这个系统尚不完善，依然需要主要研究员鲁维克的知识—他的记忆。而游戏中神秘组织的其中一个目的，就是要进入鲁维克的精神世界，夺走他的记忆，并消灭这个狂人。而鲁维克自然不可能坐以待毙，他一面在精神世界中布下重重陷阱防止他人的“入侵”，一面寻找离开自己的大脑逃出生天的机会。游戏中的精神世界是鲁维克主导的世界，当其他人与鲁维克同步后，会受到鲁维克的影响，同时自身的精神排斥本能共同作用，大部分人的结果都是精神崩溃而变成游戏中我们看到的怪物。与鲁维克的同步程度较高的人变的怪物可以被鲁维克使唤，甚至变得和鲁维克相似（游戏后期的兜帽姨妈敌人）。游戏初期开车的**与在村中遭遇的一个受害者，还有时不时发作的眼镜受甚至主角本人，都是因为鲁维克的干涉影响才会变成怪物。回到最初的内容，游戏中的赛巴斯提安已经受到了鲁维克的影响并突变，而在之后被“自己”枪击后，回到精神世界就立刻恢复了。再结合stem系统的作用是“同步”，我们或许能做一个大胆的猜想—游戏中玩家操作的赛巴斯提安并不是赛巴斯提安自己！而真正的赛巴斯提安，或许正是操纵这一切的神秘组织的重要领导，或者重要执行人之类的角色。我们来看看赛巴斯提安在游戏中的各种奇怪的现象
1.赛巴斯提安对自己的过去并没有任何反应，无论是自己的那件非常重视的风衣的丢失，还是在有穿越镜的房间中发现自己过去的笔记，都没有任何反应，就像玩家自己不知道赛巴斯提安的过去一样，游戏中的赛巴斯提安可能也不知道自己的过去。2.在发现的有关赛巴斯提安自己的过去的文本中，可以发现赛巴斯提安与这次事件并非完全无关—他自己的妻子与女儿或许已卷入神秘组织中，而赛巴斯提安自己，最终对这个神秘组织也展开了调查，并似乎有重大突破—游戏中的赛巴斯提安同样不知情，“玩家操纵的赛巴斯提安”可能真的没有过去的记忆
3.镜子里的神秘医院与“记录”。护士有句话大致意思是：“你不做记录的话或许无法证明你曾经存在过”。游戏中第一次记录是强制的，为什么要在这个神秘的空间中进行“记录”？4.深入调查了这个神秘组织的“现实中的赛巴斯提安”又做了些什么？5.游戏中多次强调过了赛巴斯提安的过去，但“会映照参与者的体验与对世界的印象而形成的精神世界”中却几乎没有出现任何与赛巴斯提安的过去的记忆有关的场景—照理说失去妻女以及一段时间的堕落这样巨大的阴影，不可能在精神世界中没有投射。那更可以说明游戏中的赛巴斯提安没有过去的详细记忆
那么我们就能够有个大致清晰的阴谋走向猜测了，因为妻女卷入，赛巴斯提安带着自己的助手眼镜受调查神秘组织，而神秘组织早已安插特工基曼在赛巴斯提安身边。中间发生了什么不得而知，最终赛巴斯提安与神秘组织发展成了合作的关系，目的是共同解决鲁维克霸占stem系统的问题。然而这个行动是非常危险的，一旦深入同步，或许就没有机会生还。所以这次行动中的三人分别使用了不同的进入这个世界的方法：
眼镜受—使用了最普通同步方法—直接连接，和他一样的还有第一关中开车的警探。警探因为意志不够坚强（第一章中表现出了明显的绝望）而被鲁维克影响变成了怪物，而眼睛受在设定里就可知，他的精神力和意志是非常坚强的。虽然一度低落产生突变，但是得到了“赛巴斯提安”的鼓励后，再也没出现突变状况。可以说是选择了仅适合他的连接方式。基曼—浅层同步，虽然能进入那个世界，但行动时间似乎受限。游戏中有多次基曼突然消失的情况，比较明显的一次是眼镜受受伤后去找救护车取药的那段，照理说路线是与我们玩家一样的，但整个过程中基曼都消失了。最后玩家回到巴士却又莫名的出现了。以及那关之后巴士出事后，基曼也再次神秘失踪。可以推断，基曼所使用的同步方式，不会受鲁维克的影响，风险非常低，但是能做的事也非常少
赛巴斯提安—代理同步，赛巴斯提安作为事件的主要执行人，要面对的或许都是最危险的情况，所以赛巴斯提安选择了风险最小的方法—以自己不完整的人格与记忆替换到其他受试者的精神中，从而保证同步中的状况稳定，而通过把其他的实验者的精神变成他自己的精神，经历事件后的记忆也可以很方便的同步回自己本体的记忆中。同时在精神世界中，通过那个护士—神秘组织的另一个执行人，创造一个安全的环境，并对他的进行状况及记忆进行“记录”从而可以让在代理他的受害者的精神被鲁维克抹杀后，再换一个代理，继续进行“游戏”
上面有提到那个有护士的医院，其实那个医院应该就是神秘组织给赛巴斯提安的“后勤保障部”除了提供记录外，还帮忙提供装备补给，能力改造等。首先，在哪个房间中获得补给的方法是使用在鲁维克世界中打碎女神像获得的钥匙，这个钥匙或许可以说是鲁维克精神世界中的“漏洞”一般的东西，研究人员可以通过这个“漏洞”像**系统一样短暂骇入精神世界，给赛巴斯提安提供帮助
用脑残液强化也是差不多的道理，脑残液的来源就是鲁维克的精神产物被击破后流出的物质，利用这个物质研究人员可以加强对鲁维克的精神世界的干涉，将主角的能力“设定”得更高，从而达成像游戏中那样强化的目的。随着游戏发展，我们可以看到那个医院渐渐的变得破败不堪，其实原因正是鲁维克发现了神秘组织安插在自己的精神世界中的这个“后勤保障部”并进行干涉。在后期甚至逼得那个辅助主角的“护士”脱离了同步（游戏中可以发现资料“护士知道得太多而付出代价”）
而莱利斯这个角色其实就是一个普通的精神病患，他的特点是会接受并模仿他人，他的精神条件正是鲁维克想要的，可以达成完全同步的精神。所以莱利斯其实是神秘组织用来引诱鲁维克的诱饵。然而最后鲁维克还是与莱利斯成功达成了同步。在自己的精神转移到了莱利斯的身上后，我们可以看到莱利斯自己化为虚无，说明莱利斯自己的精神已经从那个精神世界中消失。而鲁维克因为转换了自己的精神，所以之前由鲁维克自己主导的这个精神世界发生了崩坏与暴走，鲁维克也化身成了游戏的最终boss，混乱的负面情绪*体。而最后意外发生了，在最后消灭鲁维克的瞬间—玩家在游戏里看到的演出是鲁维克一口咬向赛巴斯提安，而赛巴斯提安出手反击—在这一瞬间鲁维克反而与赛巴斯提安发生了同步连接。最终，因为鲁维克的消失，世界的主导权被交给了游戏中的赛巴斯提安—或许只是某个受害者—他仍然以为自己是“赛巴斯提安”。在游戏结局时所处的世界依然是精神世界，而玩家可以看到一个相对完整正常的世界，是因为世界就是这个“赛巴斯提安”主导的。而鲁维克依然在这个“赛巴斯提安”的精神里面，并依然保持着一定的干涉力，所以最后赛巴斯提安会发现以鲁维克的走路姿势远去的莱利斯。在这个精神世界中，出现了其他的“人类”，或许组织已经针对目前发生的新的情况，再次配备了新的特工同步进入这个精神世界搜寻鲁维克，毕竟这个以赛巴斯提安主导的精神世界比鲁维克的安全太多，而接下来还会发生什么，现在我们还没有任何办法能知道。(不过本人认为赛叔没有反应应该是酗酒选择性遗忘的原因.而失踪报道和新闻报纸属于植入意识.真假参半便于控制赛叔.而赛叔和博士一行人应该是被控制参与连接.看博士在1章和3章的反应对比就知道)