注：1★特别篇 2◆动画原创
1996年(001~042)
01 云霄飞车**事件 柯南&新一02 社长千金**事件 03 偶像密室**事件 04 大都会暗号地图事件 05 新干线大**事件 06 情人节**事件◆07 每月一件礼物威胁事件 08 美术馆**事件 09 天下第一夜祭**事件 10 足球选手恐吓事件 11 钢琴奏鸣曲月光**事件★12 步美被诱拐事件 13 奇怪的寻人事件 14 谜样的讯息**事件◆15 消失的尸体**事件 16 古董收藏家**事件 17 百货公司挟持事件◆18 六月新娘**事件 19 电梯**事件◆20 鬼屋**事件 21 电视剧外景队**事件◆22 豪华客轮连续**事件(前篇)23 豪华客轮连续**事件(后篇)24 丧失记忆的美少女事件◆25 真假人质绑票案◆26小五郎同学会**事件(前篇)27小五郎同学会**事件(后篇)28 爱犬约翰**事件◆29 电脑**事件◆30 不在场证明**事件◆31 电视台**事件 32 咖啡店**事件 33 侦探团生还事件◆34 山庄绷带怪人**事件(前篇)35 山庄绷带怪人**事件(后篇)36 星期一晚七点三十分**事件◆37 仙人掌花**事件◆38 红**火祭**事件 39 优胜锦旗被割事件◆40 企业家千金**事件(前篇)41 企业家千金**事件(后篇)42 卡拉ok厅**事件
1997年(043~085)
43 江户川柯南被绑事件 44 堀田三兄弟**事件◆45 敷面膜**事件◆46 雪山山庄**事件 47 健身俱乐部**事件◆48 外交官**事件(前篇)49 外交官**事件(后篇)50 图书馆**事件 51 高尔夫练习场**事件◆52 雾天狗传说**事件★53 神秘凶器**事件◆54 电玩公司**事件 55 列车手法**事件◆56 清洁车**事件◆57 福尔摩斯迷**事件(前篇)58 福尔摩斯迷**事件(后篇)59 第一次购物**事件◆60 插画画家**事件 61 幽灵船**事件(前篇)◆62 幽灵船**事件(后篇)◆63 大怪兽哥美拉**事件 64 第三个指纹**事件◆65 螃蟹和鲸鱼**事件◆66 夜路**事件◆67 舞台女演员**事件◆68 暗夜男爵**事件(事件篇)69 暗夜男爵**事件(疑惑篇)70 暗夜男爵**事件(解决篇)71 痴恋狂**事件◆72 三胞胎别墅**事件 73 少年侦探团遇难事件◆74 死神阵内**事件◆75 金融公司社长**事件 76 银行抢匪**事件◆77 柯南vs怪盗基德★78 名门连续惨死事件（前篇）79 名门连续惨死事件（后篇）80 当红歌星**事件（前篇）81 当红歌星**事件（后篇）82 流浪画家**事件◆83 综合医院**事件◆84 滑雪别墅**事件(前篇)85 滑雪别墅**事件(后篇)
1998年(086~128)
086 诱拐现场特定事件 087 白鹤报恩**事件◆088 德休拉别墅**事件(前篇)◆089 德休拉别墅**事件(后篇)◆090 花香**事件◆091 强盗犯人住院事件 092 恐怖登山**事件(前篇)◆093 恐怖登山**事件(后篇)◆094 雪女传说**事件◆095 小五郎约会**事件◆096 走投无路的名侦探 连续两大**事件★097 离别美酒**事件◆098 名陶艺家**事件(前篇)099 名陶艺家**事件(后篇)100 初恋情人回忆事件(前篇)101 初恋情人回忆事件(后篇)102 古装演员**事件(前篇)103 古装演员**事件(后篇)104 新闻照片**事件◆105 盗贼集团别墅事件(前篇)106 盗贼集团别墅事件(后篇)107 鼹鼠星人之谜事件(前篇)◆108 鼹鼠星人之谜事件(后篇)◆109 侦探团大追击事件◆110 烹饪教室**事件(前篇)◆111 烹饪教室**事件(后篇)◆112 帝丹小学七大离奇事件 113 白色海滩**事件 114 有氧潜水**事件(前篇)115 有氧潜水**事件(后篇)116 推理小说家失踪事件(前篇)117 推理小说家失踪事件(后篇)118 浪花连续**事件★119 假面超人**事件◆120 蜜蜂鸡尾酒**事件◆121 浴室密室事件(前篇)122 浴室密室事件(后篇)123 天气预报小姐诱拐事件◆124 神秘的**者**事件(前篇)◆125 神秘的**者**事件(后篇)◆126 旅行戏团**事件(前篇)◆127 旅行戏团**事件(后篇)◆128 黑暗组织10亿**事件 黑衣组织1999年(129~173)
129 来自黑衣组织的女子★130 竞技场无差别胁迫事件(前篇)131 竞技场无差别胁迫事件(后篇)132 魔术爱好者**事件(事件篇)133 魔术爱好者**事件(疑惑篇)134 魔术爱好者**事件(解决篇)135 消失的凶器搜索事件◆136 蓝色古堡探索事件(前篇)137 蓝色古堡探索事件(后篇)138 最终播映**事件(前篇)139 最终播映**事件(后篇)140 sos！步美传达的讯息◆141 结婚前夜密室事件(前篇)142 结婚前夜密室事件(后篇)143 疑惑的天体观测◆144 上野出发的北斗星3号(前篇)145 上野出发的北斗星3号(后篇)146 本厅刑事恋爱物语(前篇)147 本厅刑事恋爱物语(后篇)148 地上电车紧急刹车事件◆149 游乐园高空弹跳事件◆150 汽车**事件的真相(前篇)◆151 汽车**事件的真相(后篇)◆152 神秘老人失踪事件◆153 园子的夏日海滩冒险物语(前篇)154 园子的夏日海滩冒险物语(后篇)155 水中的钥匙密室事件◆156 本厅刑事恋爱物语2(前篇)157 本厅刑事恋爱物语2(后篇)158 沉默的环状线◆159 诡异的五重塔传说(前篇)◆160 诡异的五重塔传说(后篇)◆161 流过流水亭的杀机◆162 飞天密室！工藤新一最初的事件★163 月亮、星星与太阳的秘密(前篇)164 月亮、星星与太阳的秘密(后篇)165 少年侦探队消失事件◆166 鸟取县蜘蛛公馆的怪事(事件篇)167 鸟取县蜘蛛公馆的怪事(疑惑篇)168 鸟取县蜘蛛公馆的怪事(解决篇)169 维纳斯之吻◆170 黑暗中的死角(前篇)171 黑暗中的死角(后篇)172 复活的死亡讯息(前篇)173 复活的死亡讯息(后篇)
2000年(174~218)
174 二十年的杀意 圣佛尼号连续**事件★175 被杀了四次的男人 176 与黑暗组织的再会(灰原篇)177 与黑暗组织的再会(柯南篇)毛利兰178 与黑暗组织的再会(解决篇)179 咖啡厅卡车突然撞入事件◆180 红色的杀机夜想曲(前篇)◆181 红色的杀机夜想曲(后篇)◆182 第九个门大搜查◆183 危险的处方笺◆184 诅咒假面的冷笑★185 被**的名侦探(前篇)◆186 被**的名侦探(后篇)◆187 在黑暗中传出的神秘枪声◆188 危命的复活 洞窟内的侦探团 189 危命的复活 负伤的名侦探 190 危命的复活 第三个选择 191危命的复活 黑衣骑士 192 危命的复活 归来的新一 193 危命的复活 约定的场所 194 意味深长的八音盒(前篇)195 意味深长的八音盒(后篇)196 看不见的凶器 小兰的初次推理◆197 超级汽车陷阱(前篇)◆198 超级汽车陷阱(后篇)◆199 嫌疑犯，毛利小五郎(前篇)200 嫌疑犯，毛利小五郎(后篇)201 第10个乘客(前篇)◆202 第10个乘客(后篇)◆203 依卡路斯的黑色之翼(前篇)◆204 依卡路斯的黑色之翼(后篇)◆205 本厅刑事恋爱物语3(前篇)206 本厅刑事恋爱物语3(后篇)207 完美的名推理◆208 迷宫的入口 巨大神像的愤怒★209 龙神山坠车事件◆210 五彩传说的水底龙宫(前篇)◆211 五彩传说的水底龙宫(后篇)◆212 松茸、熊与少年侦探团(前篇)213 松茸、熊与少年侦探团(后篇)214 怀古饭店的神秘事件◆215 复仇海滩(前篇)◆216 复仇海滩(后篇)◆217 目暮尘封的秘密(前篇)218 目暮尘封的秘密(后篇)
2001年(219~262)
219 被召集的名侦探！工藤新一vs怪盗基德★220 满口谎言的委托人(前篇)221 满口谎言的委托人(后篇)222 人鱼失踪记(事件篇)223 人鱼失踪记(推理篇)224 人鱼失踪记(解决篇)225 买卖繁盛的秘密◆226 格斗游戏的陷阱(前篇)227 格斗游戏的陷阱(后篇)228 潜藏杀机的陶艺教室(前篇)229 潜藏杀机的陶艺教室(后篇)230 谜一样的乘客(前篇)231 谜一样的乘客(后篇)232 公寓坠落事件◆少年侦探队233 无法消灭的证据(前篇)234 无法消灭的证据(后篇)235 酒窖密室事件◆236 南纪白滨的神秘之旅(前篇)◆237 南纪白滨的神秘之旅(后篇)◆238 大阪的3k事件(前篇)239 大阪的3k事件(后篇)240 新干线护送事件(前篇)241 新干线护送事件(后篇)242 元太少年的灾难 243 毛利小五郎的冒充者(前篇)244 毛利小五郎的冒充者(后篇)245 向日葵馆的枪声◆246 陷入网中的谜团(前篇)247 陷入网中的谜团(后篇)248 治愈森的不在场证明◆249 偶像们的秘密(前篇)250 偶像们的秘密(后篇)251 ok牧场的悲剧◆252 图画中的**犯◆253 本厅**恋爱物语4(前篇)254 本厅**恋爱物语4(后篇)255 松江玉造连句十四胜负(前篇)◆256 松江玉造连句十四胜负(后篇)◆257 世间奇妙的天谴◆258 来自芝加哥的男子(前篇)259 来自芝加哥的男子(后篇)260 摇动的餐馆◆261 降雪之夜的恐怖传说(前篇)◆262 降雪之夜的恐怖传说(后篇)◆
2002年(263~303)
263 大阪双重谜团 浪花剑士和太阁之城★264 法庭上的对决 妃vs小五郎(前篇)◆265 法庭上的对决 妃vs小五郎(后篇)◆266 情人节的真实(事件篇)267 情人节的真实(推理篇)268 情人节的真实(解决篇)269 犯罪的纪念品(前篇)270 犯罪的纪念品(后篇)271 情急之下的应变之道(前篇)272 情急之下的应变之道(后篇)273 机智婆婆失踪事件◆274 幽灵屋的真相(前篇)275 幽灵屋的真相(后篇)276 **手册遗失事件◆277 英语老师vs关西名侦探(前篇)278 英语老师vs关西名侦探(后篇)279 疯狂足球迷(前篇)280 疯狂足球迷(后篇)281 小小目击者◆282 水流石庭的玄机(前篇)◆283 水流石庭的玄机(后篇)◆284 中华街 雨中的似曾相识(前篇)285 中华街 雨中的似曾相识(后篇)286 工藤新一ny事件(事件篇)287 工藤新一ny事件(推理篇)288 工藤新一ny事件(解决篇)289 迷途森林的光彦(前篇)290 迷途森林的光彦(后篇)291 孤岛的公主与龙宫城(事件篇)292 孤岛的公主与龙宫城(追求篇)293 孤岛之花与海龙宫(解决篇)294 爱与决心的粉碎前篇)◆295 爱与决心的粉碎(后篇)◆296 屋形船震惊的钓鱼◆297 法庭对决2 妃英里vs九条(前篇)◆298 法庭对决2 妃英里vs九条(后篇)◆299 友情与杀意的关门海峡(前篇)◆300 友情与杀意的关门海峡(后篇)◆301 恶意与圣者的游行(前篇)302 恶意与圣者的游行(后篇)灰原哀303 归来的被害者◆
2003年(304~344)
304 震动的警视厅 1200万名人质★305 看不见的嫌犯(前篇)306 看不见的嫌犯(后篇)307 残留下来的无声证言(前篇)308 残留下来的无声证言(后篇)309 与黑暗组织的接触(交涉篇)310 与黑暗组织的接触(追踪篇)311 与黑暗组织的接触(决死篇)312 染上夕阳的布偶(前篇)313 染上夕阳的布偶(后篇)314 扶手损毁的了望台◆315 阳光照耀的地方◆316 被玷污的蒙面英雄(前篇)317 被玷污的蒙面英雄(后篇)318 幸运的香烟盒(前篇)◆319 幸运的香烟盒(后篇)◆320 忍法制造不在场证明之术◆321 消失的**脱逃车(前篇)◆322 消失的**脱逃车(后篇)◆323 服部平次一筹莫展(前篇)324 服部平次一筹莫展(后篇)325 火焰中的红马(事件篇)326 火焰中的红马(搜索篇)327 火焰中的红马(解决篇)328 生日酒之谜◆329 金钱买不到的友情(前篇)330 金钱买不到的友情(后篇)331 疑惑的咖喱饭(前篇)332 疑惑的咖喱饭(后篇)333 相似的两位公主(前篇)334 相似的两位公主(后篇)335 东都显影所的秘密(前篇)336 东都显影所的秘密(后篇)337 坠落事件的内幕◆338 四台保时捷(前篇)339 四台保时捷(后篇)340 隐藏在厕所里的秘密(前篇)341 隐藏在厕所里的秘密(后篇)342 豪斯登堡的新娘★343 便利商店的陷阱(前篇)344 便利商店的陷阱(后篇)
2004年(345~383)
345 与黑衣组织正面对决 满月之夜的双重谜案★346 寻找屁股上的印记(前篇)347 寻找屁股上的印记(后篇)348 爱与幽灵与地球遗产(前篇)◆349 爱与幽灵与地球遗产(后篇)◆350 被遗忘的手机(前篇)351 被遗忘的手机(后篇)352 钓鱼大赛的悲剧(前篇)◆353 钓鱼大赛的悲剧(后篇)◆354 小小的委托人(前篇)355 小小的委托人(后篇)356 怪盗基德惊异的空中漫步★357 恋人是春天的回忆◆358 本厅**恋爱物语5(前篇)359 本厅**恋爱物语5(后篇)360 不可思议的春天甲虫◆361 帝丹高中校园灵异事件(前篇)362 帝丹高中校园灵异事件(后篇...