第一季:2003年 season one:2003
第1集 things change 风云突变
第2集 a better mousetrap 漂亮的捕鼠器
第3集 attack of the mousers 攻击捕鼠器
第4集 meet casey jones 结识凯茜琼斯
第5集 nano 纳米机器人
第6集 darkness on the edge of town 城市边缘的黑暗
第7集 the way of inv**ibility 隐身术
第8集 fallen angel 坠落的天使
第9集 garbageman 垃圾大王
第10集 the shredder strikes part one 铁面人出击（上）
第11集 the shredder strikes part two铁面人出击（下）
第12集 the unconvincing turtle titan 神龟巨人
第13集 notes from the underground part one 地下来信（上）
第14集 notes from the underground part two 地下来信（中）
第15集 notes from the underground part three 地下来信（下）
第16集 the king 动物之王
第17集 the shredder strikes back part one 施莱德的反击（上）
第18集 the shredder strikes back part two 施莱德的反击（下）
第19集 tales of leo 达芬奇的故事
第20集 the monster hunter 怪物猎人
第21集 return to new york part one 再回纽约（上）
第22集 return to new york part two 再回纽约（中）
第23集 return to new york part three再回纽约（下）
第24集 long raph and cub 孤独的拉斐尔和孩子
第25集 the search for splinter pare one 寻找斯普林特（上）
第26集 the search for splinter pare two 寻找斯普林特（下）
第二季:2003/2004年 season two:2003/2004
第27集 the fugitoid 富基托德
第28集 the trouble with triceratons 泰瑟兰盾的麻烦
第29集 the big house 大房间
第30集 the arena 竞技场
第31集 triceraton wars 泰瑟兰盾之战
第32集 secret origins part one 神秘的起源（一）
第33集 secret origins part two神秘的起源（二）
第34集 secret origins part three神秘的起源（三）
第35集 reflections 反省
第36集 the ultimate ninja 终极忍者
第37集 the return of nano 现代爱情－纳米的回归
第38集 what a croc 鳄鱼
第39集 return to the underground 回到地下
第40集 city at war part one 城市战争（一）
第41集 city at war part two 城市战争（二）
第42集 city at war part three 城市战争（三）
第43集 junklant** 垃圾兰蒂斯
第44集 the golden puck 金球
第45集 rogue in the house part one 房间里的**（一）
第46集 rogue in the house part two 房间里的**（二）
第47集 april’s artifact 爱普利尔的艺术品
第48集 return of the justice force 正义力量的再现
第49集 the big brawl part one 超级竞赛（一）
第50集 the big brawl part two 超级竞赛（二）
第51集 the big brawl part three 超级竞赛（三）
第52集 the big brawl part four 超级竞赛（四）
第三季:2004/2005年 season three:2004/2005
第53集 the chr**tmas aliens 外星人的圣诞节
第54集 space invaders part one 太空侵略者（—）
第55集 space invaders part two 太空侵略者（二）
第56集 space invaders part three 太空侵略者（三）
第57集 worlds collide part one 世界之战（—）
第58集 worlds collide part two 世界之战（二）
第59集 worlds collide part three 世界之战（三）
第60集 touch and go 一触即发
第61集 hunted 追捕
第62集 h.a.t.e.h.a.t.e.集团
第63集 nobody's fool 大智若愚
第64集 new blood 新血
第65集 the lesson 教训
第66集 the darkness within 黑暗之中
第67集 m**sion of gr**ity 重力的任务
第68集 the entity below 事实的背后
第69集 time tr**ails 时间之旅
第70集 hun on the run 韩的惨败
第71集 reality check 真实的实验
第72集 across the universe 穿越宇宙
第73集 same as it never was 从未发生
第74集 the real world part one 现实的世界（—）
第75集 the real world part two 现实的世界（二）
第76集 b**hop's gambit b**hop的抉择
第77集 exodus part one 离开（—）
第78集 exodus part two 离开（二）
第四季:2005/2006年season four:2005/2006
第79集 cousin sid 同类
第80集 the people’s choice 人们的选择
第81集 sons of the silent age 寂静年代之子
第82集 dragon’s brew 紫龙帮的阴谋
第83集 i,monster 我，怪物！第84集 grudge match 怨恨的较量
第85集 wing and a prayer 羽翼和祈祷
第86集 bad day 糟糕的一天
第87集 aliens among us 地球上的外星人
第88集 dragons r**ing 紫龙帮的崛起
第89集 still nobody 还是nobody
第90集 all hallows thieves 地狱的强盗
第91集 samurai tour**t 武士的征服
第92集 the ancient one 古老的传说
第93集 scion of the shredder 施莱德的后裔
第94集 prodigal son 浪子回头
第95集 outbreak 爆发
第96集 trouble with augie augie的麻烦
第97集 insane in the membrane 疯狂的隔膜
第98集 return of s**anti part 1回到s**anti（—）
第99集 return of s**anti part 2回到s**anti（二）
第100集 a tale of master yoshi 尤西**的故事
第101集 adventures in turtle-sitting 龟栖息地的冒险
第102集 good genes part i 优秀的基因（—）
第103集 good genes part ii 优秀的基因（二）
第104集 the ninja tribunal 忍者裁判所
答案补充 第五季"忍者裁判所":2006/2007年 season 5:ninja tribunal 2006/2007
第105集 lap of the gods 听命运安排
第106集 demons and dragons 邪魔与龙
第107集 legend of the five dragons 五龙传奇
第108集 worlds than one 无尽空间
第109集 beginning of the end 末端的起点
第110集 nightmares recycled 回收梦魇
第111集 membership drive 资格
第112集 new world order part i 世界新秩序 1
第113集 new world order part ii 世界新秩序 2
第114集 fathers&sons 父与子
第115集 past present 当前的难关
答案补充 第116集 enter the dragons part i 深入五龙 1
第117集 enter the dragons part ii 深入五龙 2
备注：在此季度里面，乌龟兄弟们将备不知名的木制傀儡忍者带到古代日本所谓“忍者裁判所”，在那里，他们有了新的伙伴，学到了利用能量变身！而另一方面，五大元素忍者，露出了他们的本体，也正在策划新一轮的进攻！第六季"勇往直前":2006/2007年 season 6:fast forward 2006/2007
第118集 future shellshock 震惊未来！第119集 obsolete 过时
第120集 home invasion 家里的入侵者
第121集 headlock prime 一招为先
第122集 playtime's over 游戏时间结束
第123集 b**hop to knight“b**hop”还活着！