1.入学篇（1-26）
001.继承**游戏的人
002.火焰翼人
003.星型人工智慧
004.五重合体vwxyz
005.黑暗的恶魔牌组
006.羽翼粟子球的奇迹
007.翔的交通工具牌组
008.最强！电子终极龙！009.必杀一击！回到饭桌！010.十代和翔宿舍决斗（前篇）
011.十代和翔宿舍决斗（后篇）
012.氧气+氢气=h2o龙
013.野性解放！猴子决斗！014.vs人造人索加
015.青春的网球决斗
016.哥布林王
017.抽牌！抽牌！抽牌！018.vs游戏牌组（前篇）
019.vs游戏牌组（后篇）
020.恋爱的少女
021.融合封印！十代vs三泽（前篇）
022.融合封印！十代vs三泽（后篇）
023.没劲！木瓜豆腐决斗！024.复活！万丈目闪电！025.vs万丈目闪电（前篇）**龙的威胁
026.vs万丈目闪电（后篇）**龙lv7
2.三幻魔篇（或七星篇）（27-49）
027.课外学习是黑暗决斗（前篇）
028.课外学习是黑暗决斗（后篇）
029.vs darkness（前篇）真红眼黑龙的挑战
030.vs darkness（后篇）真红眼黑龙的攻击
031.库洛偌斯 vs 吸血美女卡缪拉
032.恺撒 vs 卡缪拉！幻魔之门发动
033.光辉！光闪羽翼人！034.温泉旅情！青眼白龙！035.兄弟的团结！搞乱三角飓风！036.三泽地vs亚马逊！娶亲决斗！037.肉弹决斗！亚马逊的死亡擂台！038.水中决斗！传说中的城市亚特兰堤斯！039.名侦探闪电 vs 黑蝎盗贼团
040.h.e.r.o 闪光！041.暗之斗牛场 发动！**vs 泰坦
042.学园祭决斗！黑魔导女孩乱入
043.给**的第二次恋爱机会！044.第七人的影子
045.vs armnile！e.hero完全封印
046.地水炎风融合！贤者之石！047.** vs 万丈目！人工智能天使－弁天－
048.vs 影丸（前篇）两个幻魔
049.vs 影丸（后篇）三幻魔觉醒
3.光之波动篇（或破灭之光篇）（050—104）
050.准人 vs 库洛偌斯！艾雅斯岩的日出！051.vs 恺撒（前篇）能量融合×电子终极龙
052.vs 恺撒（后篇）最终融合
053.命运的开始！新入生 爱德.菲尼克斯
054.闪电 vs 精英君 金属捣乱王出发
055.寺院的剑山登场
056.翔 vs 昆虫少女！昆虫女王
057.恺撒 vs 爱德职业联盟赛的决斗
058.vs 爱德（前篇）e.hero 对 e.hero!059.vs 爱德（后篇）命运的 d.hero!060.** vs 吹雪 兄妹的偶像之路
061.斋王登场！命运的占卜卡组
062.新e.hero！neos！063.剑山 vs 咖哩魔人！辛辣决斗！064.翔 vs 剑山！对大哥的火热想念决斗！065.地狱恺撒亮聚合机甲终结龙！066.十代初梦决斗！067.vs爱德（前篇）新的力量！水之新生侠.水之海豚侠
068.vs爱德（后篇）炎之新生侠.火炎neos！069.克洛诺斯 vs 拿破仑！玩具士兵的进军！070.** vs 万丈目白闪电！071.vs 海上霸者 巨大战舰-旋轮开进！072.破坏“卡组破坏“吧
073.剑山 vs 斋王！这是恐龙dna！074.黄泉青蛙！生之青蛙！死亡青蛙！075.修学旅行搭档决斗
076.究极合体！王者联盟
077.恐怖的四帝卡组！造物主ema！078.最强组合！十代&爱德！（前篇）
079.最强组合！十代&爱德！（后篇）
080.绝望国度的美少女爱丽思！081.知识问答比赛！vs 猜谜卡组！082.三泽大地 vs 万丈目！083.地狱恺撒亮vs师尊鲛岛
084.世界大会开幕！目标第一！085.操纵神卡「太阳神的翼神龙」的男子！086.决斗的花道
087.加油！捣乱3人组（上集）
088.加油！捣乱3人组（下集）
089.地狱凯撒vs暗吹雪
090.学园的自尊心
091.一回杀的死神
092.三方决斗
093.白夜的决斗！十代vs**（前篇）
094.白夜龙！十代vs**（后篇）
095.仁至义尽的兄弟决斗 亮vs翔
096.相对性地形！十代vs天才博士
097.登场！谜之世界冠军！098.终于发动！究极的d之卡
099.十代vs镭射卫星的恐怖
100.究极的秘密仪式「the world」
101.爱德 必杀的一击！blood d」
102.光之波动 vs 尼奥斯
103.十代危机！场地魔法「光之结界」
104.胜利的去向？十代 vs 斋王
4.尤贝尔篇（105—156）
105.新学期开始！波折的预感
106.十代和宝玉兽卡组的约翰
107.新空间vs宝玉兽
108.教授·眼镜蛇的刺客
109.十代与炎之奥布赖恩
110.暴龙剑山与化石龙之吉姆
111.万丈目闪电与云卡组之阿蒙
112.闪电vs台风之眼
113.十代vs背叛的元素英雄
114.绝体绝命！满是伤痕的英雄
115.搜捕精灵的基斯
116.宝玉兽vs地狱的守门犬
117.决战！十代vs科布拉教授
118.恐怖！毒蛇王维诺米农
119.三重结体融合！岩浆尼奥斯
120.异世界的战斗！宝玉兽vs神鹰**
121.沙漠的生存战！约翰vs蚁地狱
122.决斗学园危机！丧尸学生的恐怖！123.礼救出作战！e.hero vs 堕天使护士
124.学园**！空腹决斗
125.约翰·吉姆·奥布赖恩vs假面三骑士
126.十代vs万丈目·龙骑士暗黑之剑
127.封印解除者·马尔登
128.宝玉兽vs电子终结龙
129.三幻魔的威胁！十代vs马尔登
130.虹龙觉醒
131.皇牌卡大集合！打开吧，次元之门！132.赌上性命的决斗
133.十代vs暗黑界的斥候斯卡
134.十代vs暗黑界的骑士祖尔
135.十代vs暗黑界的狂王布隆
136.邪心经典发动！暗黑界之魔神虹
137.翔的决心！友情之证」
138.霸王降临·死亡决斗者们
139.暗黑融合！业火炎魔！140.空前绝后·超融合发动
141.恐怖的霸王！彷徨的奥布赖恩
142.生存下来的胜利者就是正义！霸王vs奥布赖恩
143.火山恶魔vs最凶之邪心英雄
144.发动！究级封印解放仪式术
145.究极封印神艾克佐迪奥斯召唤！146.被封印的融合
147.因缘的对决！电子流vs宝玉兽
148.究极龙对决！电子终结vs黑虹
149.魔神对抗！幻魔vs艾克佐迪亚
150.“尤贝尔”召唤！151.neos vs 高等宝石兽
152.超融合发动！彩虹新生侠
153.被选中之卡对决！元素英雄vs尤贝尔
154.苏醒的霸王十代！155.彩虹新生侠vs尤贝尔究极态
156.十代复活！新的启程
5.darkness篇（157—180）
157.潜在的威胁！谜之来访者」
158.再见吧决斗校园！十代选择的道路
159.darkness的真相！十代vs吹雪
160.融合之魂！新生侠vs五神龙
161.shall we duel-我们去决斗好吗？配对决斗的邀请
162.十代vs** 隐藏了心意的覆盖卡
163.来自精神震撼者的挑战书
164.被继承的电子暗黑龙
165.目标！万丈目，成为职业决斗者之路！166.**龙vs龙骑士·d·end
167.报恩的决斗！克罗诺斯vs“吊车尾男孩”
168.毕业决斗开始！新生侠vs荷露斯之黑炎龙
169.决断的代价！奥布赖恩的炎之暗
170.斋王再临！绝对命运决定力」发动！171.命运之终焉！熔岩新生侠vs暗之支配者
172.决斗学园的危机！阻挡在前的宝玉兽
173.darkness的侵占 被夺去的记忆
174.发动！净界」恐怖的负影响
175.大混战！十代vs约翰vs藤原
176.羁绊守护者虹皇新生侠vs净惰骑士
177.恐怖的组合！虚无与无限」
178.最后之希望！游城十代
179.再见了十代！泪之毕业礼
180.真正的毕业决斗！十代vs传说的决斗者