精灵宝可梦金银水晶版流程：
若叶镇：
选择主角性别（水晶版）、姓名、调整时间。下楼从妈妈处得到宝可梦齿轮后调整星期。前往空木博士的研究所，从菊草叶、小锯鳄和火球鼠三只中选择一只成为冒险的搭档。经29号道路，前往吉花市。吉花市：
在吉花市遇到老人后获得宝可梦齿轮的地图卡。前往30号道路。30号道路：
前往右侧的宝可梦爷爷的家。在宝可梦爷爷的家，从大木博士处获得神奇蛋和宝可梦图鉴后返回吉花市。吉花市：
遇到劲敌并和他展开宝可梦对战。空木博士打来电话，返回若叶镇。若叶镇：
前往空木博士的研究所，为劲敌取名。经过29号道路、吉花市和30号道路，前往桔梗市。桔梗市：
前往喇叭芽之塔在顶层遇到劲敌，在和长老对战胜利后获得秘传学习器05（闪光）。在桔梗道馆，和道馆馆主阿速进行宝可梦对战。获得徽章后可以收到空木博士的电话，之后可在宝可梦中心取得波克比的蛋。前往阿露福遗迹，或直接前往32号道路。阿露福遗迹☆
捕获3种不同外观的未知图腾后可向研究员增加未知图腾图鉴。完成遗迹内的拼图后可以遇到更多形态的未知图腾。**秘密房间的谜题后，可以获得道具（水晶版）。离开阿露福遗迹，前往32号道路。32号道路：
互连洞前方宝可梦中心可以获得破旧钓竿。互连洞：
前往33号道路，进入桧皮镇。得到秘传学习器03（冲浪）后可以在互连洞最底层捕捉拉普拉斯（星期五）☆
桧皮镇：
在钢铁的家找到钢铁后前往呆呆兽之井。呆呆兽之井：
在呆呆兽之井与**手下对战。桧皮镇：
在桧皮道馆，和道馆馆主阿笔进行宝可梦对战。前往桐树林之前会与劲敌进行对战，之后进入桐树林。桐树林：
追踪大葱鸭至木炭店的小儿子处后获得秘传学习器01（居合斩）。与这里的撞树男子对话可以学会招式学习器02（头锤），之后可以撞树来遇到一些宝可梦☆
将gs球交给钢铁后可以前往神龛遇到野生时拉比（日文版，已结束，水晶版）☆
对树木使用居合斩后通过桐树林，经过34号道路到达满金市。34号道路☆
培育屋可以进行宝可梦培育。培育屋可以获得宝可梦的蛋兑换券（水晶版）。满金市：
在满金道馆，和道馆馆主小茜进行宝可梦对战。在满金市收讯塔答题后获得蓝卡☆
在奇迹自行车店可以获得自行车☆
在神奇宝贝交流中心（日文版）/宝可梦中心（非日文版）使用宝可梦的蛋兑换券兑换蛋（水晶版）☆
在神奇宝贝交流中心可以用移动适配器gb答题获得gs球（日文版，已结束，水晶版）☆
前往34号道路寻找花店店主的妹妹（水晶版）。在花店可以获得杰尼龟喷壶。前往34号道路和自然公园。自然公园：
从老师处可以获得先制之爪。可以参加捕虫大会（星期二，星期四，星期六）。34号道路：
对挡路的怪树使用杰尼龟喷壶后与树才怪对战。向36号道路树才怪附近的男子对话学会招式学习器08（碎岩）☆
经37号道路前往圆朱市。圆朱市：
前往歌舞练习场与艺妓交战，之后与老爷爷交谈得到秘传学习器03（冲浪）。前往烧焦塔，遇到米那君（水晶版），之后与劲敌交战，并在b1f放走三圣兽。在圆朱道馆，和道馆馆主小松进行宝可梦对战。获得透明铃铛后可在铃铛塔顶层遇到水君（水晶版）。获得虹色之羽后（金银版）/队伍中有三圣兽（水晶版），可在铃铛塔顶层遇到凤王。前往38号道路。解决哞哞牧场事件可以购买哞哞鲜奶☆
前往浅黄市。浅黄市：
在浅黄道馆前发现劲敌，但是道馆馆主不在。前往光辉灯塔，在顶楼遇到阿蜜，对话后需要帮阿蜜去湛蓝市拿秘传之药。可以利用移动适配器gb（日文版，已结束）/直接（非日文版）进入对战塔进行对战（水晶版）☆
经由40号水路、41号水路，经过漩涡列岛。得到秘传学习器06（潮旋）、银色之羽后，可在漩涡列岛最深处遇到洛奇亚☆
前往湛蓝市。湛蓝市：
在诚儿的家可以获得壶壶☆
在药店获得秘传之药。在湛蓝道馆，和道馆馆主阿四进行宝可梦对战。挑战道馆完毕后在道馆外阿四的妻子会赠送秘传学习器02（飞翔）☆
在占卜师房屋北方见到水君逃走，与米那君对战（水晶版）。返回浅黄市。浅黄市：
将秘传之药交给阿蜜，阿蜜会回到道馆。在浅黄道馆，和道馆馆主阿蜜进行宝可梦对战。回到圆朱市，向东前行进入42号道路，经过擂钵山前往卡吉镇。擂钵山：
与信彦对战，胜利后获得无畏小子。卡吉镇：
卡吉镇被**占领，经过43号道路向北前往愤怒之湖。43号道路走左侧需要居合斩，右侧关卡会被**勒索☆
愤怒之湖：
前往湖中心，遇到红色暴鲤龙，捕捉或击败后获得红色鳞片。回到湖边遇到渡并与其对话。回到卡吉镇。卡吉镇：
前往商店，与渡一起进入**基地。前往b3f击败**干部，之后与黑暗鸦对话得知密码。打开b2f的发电机房，击败或捕捉内部的所有顽皮雷弹。从渡手中获得秘传学习器06（潮旋）。在卡吉道馆，和道馆馆主柳伯进行宝可梦对战。出道馆会接到电话，前往满金市。满金市：
前往满金市收讯塔，至顶楼打败假局长，然后获得地下钥匙。前往满金地道，通过满金百货大楼地下室的门进入地下室，与劲敌对战，解救局长得到钥匙卡。前往满金市收讯塔2f，打败**干部，局长赠送虹色之羽（金版）/银色之羽（银版）/透明铃铛（水晶版）。离开满金市回到卡吉镇，经由44号道路前往冰雪通路。冰雪道路：
可以获得秘传学习器07（攀瀑）。穿过冰雪通路前往烟墨市。烟墨市：
在烟墨市的道馆，与道馆馆主小椿进行宝可梦对战。获胜后前往龙穴。在龙穴最深处获得升龙徽章。与大长老对话回答问题，获得后升龙徽章后再与大长老对话，根据问题的正确与否可获得会神速（答对）或瞪眼（答错）的迷你龙（水晶版）。经过45号道路和46号道路回到若叶镇。黑暗穴☆
最深处可以获得黑色眼镜。若叶镇：
与空木博士对话获得**球。从镇东侧冲浪进入关都地区的27号道路。进入都城瀑布，使用攀瀑通过，继续在27号道路前进。经过26号道路，前往宝可梦联盟大门。前往石英高原。石英高原：
与四天王及冠军进行对战。登入名人堂，回到若叶镇，城都地方剧情结束。登入名人堂后：
若叶镇
片尾制作人员名单后再开游戏，回到若叶镇，空木博士会给予船票。前往浅黄市搭乘水流号前往关都地方。水流号：
在b1f的入口与水手对话，前往1f右侧房间与水手对战
前往并穿过b1f，到达船长室，与船长身边的小女孩对话。到达枯叶市。【关都地区】
关都地区的主要任务没有严格的先后顺序。枯叶市：
在枯叶道馆，和道馆馆主马志士进行对战。在与金黄市民居内的模仿女孩对话开启失物事件后，可在宝可梦迷俱乐部会员处获得掉落的东西☆
金黄市：
在金黄市的道馆，和道馆馆主娜姿进行对战。格斗道场内可以获得气势头带☆
与民居内的模仿女孩对话开启失物事件，获得掉落的东西后交给模仿女孩可以获得定期月票☆
彩虹市：
在彩虹道馆，和道馆馆主莉佳进行对战。浅红市：
在浅红道馆，和道馆馆主阿杏进行对战。无人发电厂：
与工作人员说话开启发电厂零件事件。得到机械零件后返还，发电厂零件事件完成，可以乘坐磁浮列车并使用关都地方的收音机。华蓝市：
在发电厂零件事件中，初次进入华蓝道馆可遇到**手下。在24号道路击败**手下。击败**手下后可在华蓝道馆水中发现机械零件。前往华蓝之岬触发小霞剧情。在正辉的家给正辉的爷爷看特定宝可梦可以获得特定的进化之石☆
触发小霞剧情后，在华蓝道馆，和道馆馆主小霞进行对战。紫苑镇：
发电厂零件事件完成后，在广播塔获得扩展卡。11号道路：
用宝可梦齿轮调至宝可梦之笛频道叫醒卡比兽，可穿越地鼠洞前往尼比市。尼比市：
在尼比道馆，和道馆馆主小刚进行对战。在尼比市的老人手中可以获得银色之羽（金版，水晶版）或虹色之羽（银版）。常磐市：
青绿回到道馆后，在常磐道馆，和道馆馆主青绿进行对战。红莲岛
与青绿对话，如已收集到7枚关都地方的徽章，青绿会回到道馆。双子岛：
在红莲道馆（双子岛道馆），和道馆馆主夏伯进行对战。真新镇：
在大木博士的研究所与大木博士对话，如已击败关都8位道馆馆主，即开启前往白银山的道路。白银山：
在最深处与赤红对战，结局。【结局之后】
月见山（注：尽管到达尼比市后就可以前往月见山，但是因不涉及主线剧情鲜少有玩家会在结局前前往）：
两只皮皮在月见山广场围着一块石头跳舞，皮皮离开后对石头进行碎岩可以获得月之石（星期一）。可以与劲敌对战。石英高原：
可以与劲敌对战（星期三）。城都地方各地：
可以从星期兄弟手中获得道具。【传说的宝可梦】
雷公：全城都地区四处游走（在烧焦塔相遇后）。炎帝：全城都地区四处游走（在烧焦塔相遇后）。水君：全城都地区四处游走（金银版，在烧焦塔相遇后）。水君：铃铛塔（水晶版，得到透明铃铛后）。洛奇亚：漩涡列岛（得到银色之羽后）。凤王：铃铛塔顶（金银版，得到虹色之羽后）。凤王：铃铛塔顶（水晶版，队伍中有水君、炎帝、雷公时）。时拉比：桐树林（水晶版，给钢铁看gs球后，放到桐树林的神龛上）。