开始时候的剧情和红宝石是一样的，就不做赘述。要记得常看路标啊。从博士处取得小精灵，往上走，经过s.f path然后往右下穿越bug forest到达ultima city城镇，击败神秘人后从旁边通路向上走，再度穿越bug forest向上走到达snow soft city城镇。然后找到道馆左下方道路，沿道路行进，穿越green path往右走到达luster town城镇。向上走可以看到劲敌，击败劲敌沿路返回，最后到博士家中可以取得精灵图鉴和精灵球。[进入城镇前的一户居民家中可以得到密传机01砍树。至此冒险正式开始，准备妥当后就可以开始挑战道馆了，来到luster town城镇，挑战第1个道馆，馆主使用的是飞行系的pm，初时选木守宫和火雉鸡的朋友们要小心。击败馆主后砍树就能使用了。然后回到untima city城镇，从右方通路出来往左行进，发现有树挡路，使用密传机01砍树后继续行进，发现通路后进入经过sky path到达rentelbud city城镇，挑战第2个道馆，馆主使用的是电系的pm，初时选水跃鱼的朋友，想必这时水跃鱼已经进化了，进化后的水跃鱼就不怕电系招式了。击败馆主出馆后的剧情和红宝石一样也不赘述了。[找精灵中心内的科学家谈话，可以获得密传机06碎岩。在sky path找到右下方的通路，进入后击碎岩石，可以发现雪拉比，雪拉比使用超能力将主角带到一个神秘的地方，沿通路继续往上行进，可以再度遇见先前遇见的神秘人，击败他后再度遇到雪拉比，主角再次被超能力带到一个神秘的地方，找到精灵中心替精灵疗伤后，再出来发现已经回到了rentelbud city城镇了。进入sky path右下方的通路，击碎岩石后向下行进在sky path找到携带长翅鸥的老人，他会开船送你去polar** city城镇。下船后沿通路向下行进，经过blue path来到thin forest，击败挑战者后，继续向下行进就可以到达selaro town城镇。接下来要挑战第3个道馆，馆主使用的是钢系的pm，击败馆主后沿通路向右行进到河边后，再向下行进可以看见逃跑的某团，然后往左行进到达pina francia，看到此路标后向下行进，可以看到francia c**e进入后可以得到密传机05闪光。从francia c**e的路标往左行进至francia forest进入后可以发现海洋团，击败海洋团的老大后，一个神秘宠物出现，神宠出现后马上逃走，海洋团急忙追去，当主角准备跟踪时，被**小姐不由分说的关押起来。正当着急时，神秘人出现，他和**小姐解释后，主角被释放。主角随后跟神秘人来到一个地方，在一番谈话后主角又回到了pina francia。然后回到polar** town找刚才送你来的那个船家老人，让他送你去monatami city城镇，然后的剧情和红宝石一样，不做赘述。解决某团的事件后，在精灵中心上方找到向左行进的道路，经过side path到达ancient c**e穿越后向右行进到达destral city城镇，在该城镇的商店附近找到自行车店，得到自行车后，monatami city城镇的自行车路就可以开放,沿自行车路前行可以到达borora town城镇，先不要挑战道馆，沿商店下方通路向右行进，到达mt.blaze在这里解决某团事件和红宝石一样，不赘述。解决某团事件后，就可以挑战第4个道馆，馆主使用的是火系的pm,战胜馆主后向下行进回到自行车路入口处，被一个人拦住，随后被他带到一个地方，一个盛产黑暗系精灵的地方，[进入前要带好药品，不然死的很惨的。在最深处遇见先前的神秘人，协助神秘人击败海洋团的老大，后就会回到borora town城镇。现在已经取得4个徽章了，可以回到snow soft city挑战第5个道馆，馆主使用的是冰系的pm。战胜馆主后,到道馆上方居民家中谈话,可以获得密传机03乘浪。然后回到selaro town城镇，沿通路向右行进到河边后用乘浪继续向右行进，行进至山洞门口时向下行进，就可以到达down pour city城镇。挑战第6个道馆，馆主使用的是水系的pm。沿着monatami city城镇精的灵中心下方的道路,下行,经过see path到达海边,然后使用乘浪,往下行进,当看见右手边的小岛出现路标后上岸,然后穿越bee woods到达sun path然后再度使用乘浪向右行进,登岛以后向下行进,穿越iron path和leaf path后可以到天气研究所,接下来的剧情同红宝石,故不赘述。过桥后，继续向下沿通路行进，最后来到green valley城镇。穿越unown c**e后经过ring path向右行进，看到路标后继续沿路径行进，然后穿越lust path到达狩猎场门口，找到向下行进的路mt.pyre进入山洞深处，找到身披红色衣服的人对话，进入深处，再次遇到神秘人，接着vs黑暗洛奇亚，99级，建议不要捕获。最后向下行进经过pyre path到达mt.pyre解决这里的海洋团。接下来的剧情同红宝石，故不赘述。然后使用飞天回到monatami city城镇，在精灵中心上方采访人群中发现，有某团**了潜艇。再度使用飞天回到green valley城镇后，步行到达lust path的海边，海的对面就是retazo city城镇，首先找到城镇的精灵中心替精灵疗伤。然后找到精灵中心右上角，某团设在海里的秘密基地。击败某团的领队后，挡路的肥波鲸就会离开。回到mt.pyre门口后继续向下行进，经过cyan path到达tabuli town城镇，准备充足后就可以挑战第7道馆，馆主使用的是超能力系的pm,战胜馆主后向下行进找到左下方的通路，进入沿路径行进可以到达小智的家，与其谈话可以获得密传机08潜水，使用飞天回到retazo city城镇，沿原先肥波鲸挡路的地方向右行进，最后到达mossdeep city城镇。这里有个gym但是得不到徽章。在精灵中心下方使用乘浪向下行进，到达深水区后用潜水，找到水底山洞内的潜艇后上升，解决这里某团的事件。剧情同红宝石，故不赘述。天空变的异常起来，使用飞天来到小智家，穿越小智家右上方的fire c**e来到morient town城镇。在该城镇内找到小智，他会带领主角到 c**e of morient解决里面的神兽事件，天空就会恢复正常，也可以挑战第8个道馆，馆主使用的pm是多重属性，可以透露一下，有火焰系、电气系、黑暗系、地面系、龙系、水系。战胜馆主后终于收集了8个徽章，可以向联盟进军了。使用飞天回到ultima city城镇，在该城镇内使用乘浪后，再使用攀瀑就能来到victory road穿越后，沿路径行进就能到达联盟大厅，准备充足后开始挑战四天王及冠军。天王及冠军情况汇报：
1．虫系：
2．恶系
3．幽灵系
4．龙系
冠军是小智
1．土台龟
2．烈焰猴
3．浮潜鼬
4．姆克鹰
5．路卡力欧
6．皮卡丘
通关后拿到船票，得到了拉帝欧斯的消息，可以去关东地区的枯叶市，但不能去其他地方，从枯叶市向左冲浪，发现一座岛，有四个入口，进哪一个都无所谓，再次找到红衣人，战斗，之后进入深处，找到红衣人，再战斗，之后找到神秘人，遇到70级黑暗洛奇亚，这时应该有了**球，可以抓了，抓完就好了，现在可以疯狂抓神兽了。（建议完成剧情后在抓神兽，否则抓不了）
神兽分布
急冻鸟—cinnabar **le旁的ice **le
闪电鸟—cinnabar **le旁的thunder **le
火焰鸟—cinnabar **le旁的fire **le
超梦—从blue path冲浪，在攀瀑布，找到一个山洞destiny
梦幻—从tabuli town向下右边出口到海边，冲浪向右找到一条路，上岸进入
雷公—veronica town向右冲浪，进入electricc**e深处遇到
炎帝—从tabuli town向下左边出口到小智家，上面山洞里面（通关前就会遇到）
水君—snow soft city的洞窟中深处（只有在退潮时才行）
洛奇亚—剧情遇到，会遇到baby洛奇亚和两只黑暗洛奇亚，baby洛奇亚22级进化成洛奇亚
凤凰—cinnabar **le附近冲浪，找到一个小的潜水区域，下去，再找向上的地方，上去看到一个山洞，进入遇到（仔细找一下就可以了）
雪拉比—第一次去打联盟经过bug forest时自动遇到
雷吉洛克—pina francia中的francia c**e内部遇到
雷吉艾斯—luster town向左到lost c**e,深处遇到
雷吉斯奇鲁—veronica town向右冲浪，进入electricc**e遇到
拉帝亚斯—不明
拉帝欧斯—全区域随机遇到
盖欧卡—morient town的右下角一条小路，向下发现一个洞，里面遇到
固拉多—红宝石剧情，在morient town的c**e of origin中遇到
烈空坐—borara town向右在向上进入沙漠上方的洞，遇到
基拉祈—不明
代欧奇希斯—borara town向右在向下进入raleso town（无人镇）靠近下方一个石头时自动出现
由克希—luster town向左到lost c**e,深处遇到三圣菇，然后全部消失，在ancient c**e中自动遇到
艾姆利多—luster town向左到lost c**e,深处遇到三圣菇，然后全部消失，在thin
forest中自动遇到
亚克诺姆—luster town向左到lost c**e,深处遇到三圣菇，然后全部消失，在unownc**e中自动遇到
帝牙卢卡—luster town向左到lost c**e,深处遇到
帕路奇牙—borara town向右上山，进入左边的洞（不坐缆车），遇到
席多蓝恩—从tabuli town向下左边出口到小智家，上面山洞里面（通关后自动遇到）
雷吉奇卡斯—green valley向右走到一条河边，冲浪再攀瀑布，遇到
骑拉帝纳—从rose path冲浪，找到一个山洞blue path c**e,对着一个黑洞说话，出现
克雷色利亚—veronica town向左上冲浪，进入renica tunnel，从中间出口下去，遇到
菲欧纳—找到玛纳菲的蛋后沿原路返回，途中菲欧纳自动出现
玛纳菲—从tabuli town向下右边出口到海边，向右冲浪，从一个游泳男上方找到山洞，一直走到一个瀑布（途中要一直进洞一直出洞），看到玛纳菲的蛋顺着水流走，去追，在深处找到，找到后直接孵化进入精灵箱
达克莱伊—luster town向左到lost c**e,深处自动遇到
雪米—veronica town向上冲浪，进入花海遇到
阿鲁塞乌斯—green valley向右再向下到最下方，看到一条河，冲浪再攀瀑布，进洞，到destiny中遇到